Protein–RNA interactions for Protein: P16125

Ldhb, L-lactate dehydrogenase B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LdhbP16125 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LdhbP16125 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LdhbP16125 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LdhbP16125 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LdhbP16125 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LdhbP16125 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LdhbP16125 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LdhbP16125 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LdhbP16125 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LdhbP16125 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LdhbP16125 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LdhbP16125 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LdhbP16125 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LdhbP16125 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LdhbP16125 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LdhbP16125 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LdhbP16125 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LdhbP16125 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LdhbP16125 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LdhbP16125 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LdhbP16125 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LdhbP16125 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LdhbP16125 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LdhbP16125 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LdhbP16125 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LdhbP16125 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LdhbP16125 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LdhbP16125 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LdhbP16125 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LdhbP16125 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LdhbP16125 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LdhbP16125 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LdhbP16125 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LdhbP16125 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LdhbP16125 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LdhbP16125 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LdhbP16125 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LdhbP16125 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LdhbP16125 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LdhbP16125 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LdhbP16125 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LdhbP16125 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LdhbP16125 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LdhbP16125 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LdhbP16125 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LdhbP16125 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LdhbP16125 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LdhbP16125 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LdhbP16125 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LdhbP16125 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LdhbP16125 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LdhbP16125 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LdhbP16125 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LdhbP16125 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LdhbP16125 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LdhbP16125 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LdhbP16125 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LdhbP16125 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LdhbP16125 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LdhbP16125 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LdhbP16125 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LdhbP16125 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LdhbP16125 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LdhbP16125 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LdhbP16125 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LdhbP16125 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LdhbP16125 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LdhbP16125 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LdhbP16125 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LdhbP16125 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LdhbP16125 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LdhbP16125 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LdhbP16125 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LdhbP16125 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LdhbP16125 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LdhbP16125 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LdhbP16125 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LdhbP16125 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LdhbP16125 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LdhbP16125 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LdhbP16125 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LdhbP16125 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LdhbP16125 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LdhbP16125 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LdhbP16125 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LdhbP16125 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LdhbP16125 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LdhbP16125 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LdhbP16125 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LdhbP16125 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LdhbP16125 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LdhbP16125 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LdhbP16125 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LdhbP16125 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LdhbP16125 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LdhbP16125 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LdhbP16125 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LdhbP16125 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LdhbP16125 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LdhbP16125 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 182.1 ms