Protein–RNA interactions for Protein: P15863

PAX1, Paired box protein Pax-1, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX1P15863 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PAX1P15863 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAX1P15863 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAX1P15863 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAX1P15863 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAX1P15863 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAX1P15863 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAX1P15863 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAX1P15863 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAX1P15863 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PAX1P15863 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAX1P15863 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAX1P15863 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAX1P15863 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAX1P15863 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAX1P15863 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAX1P15863 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PAX1P15863 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PAX1P15863 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PAX1P15863 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PAX1P15863 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PAX1P15863 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PAX1P15863 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PAX1P15863 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PAX1P15863 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PAX1P15863 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PAX1P15863 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAX1P15863 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAX1P15863 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAX1P15863 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAX1P15863 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAX1P15863 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAX1P15863 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAX1P15863 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAX1P15863 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAX1P15863 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAX1P15863 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAX1P15863 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PAX1P15863 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAX1P15863 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAX1P15863 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAX1P15863 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAX1P15863 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAX1P15863 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAX1P15863 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAX1P15863 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAX1P15863 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAX1P15863 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAX1P15863 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAX1P15863 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAX1P15863 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PAX1P15863 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAX1P15863 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PAX1P15863 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PAX1P15863 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PAX1P15863 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PAX1P15863 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PAX1P15863 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PAX1P15863 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PAX1P15863 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PAX1P15863 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PAX1P15863 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PAX1P15863 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PAX1P15863 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PAX1P15863 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PAX1P15863 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PAX1P15863 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAX1P15863 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAX1P15863 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAX1P15863 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAX1P15863 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAX1P15863 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAX1P15863 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAX1P15863 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAX1P15863 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAX1P15863 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAX1P15863 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAX1P15863 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PAX1P15863 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAX1P15863 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAX1P15863 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAX1P15863 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAX1P15863 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAX1P15863 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAX1P15863 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAX1P15863 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAX1P15863 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAX1P15863 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAX1P15863 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAX1P15863 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAX1P15863 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PAX1P15863 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PAX1P15863 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PAX1P15863 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PAX1P15863 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PAX1P15863 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PAX1P15863 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PAX1P15863 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAX1P15863 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAX1P15863 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms