Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCG2P13521 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCG2P13521 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCG2P13521 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCG2P13521 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCG2P13521 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCG2P13521 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCG2P13521 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCG2P13521 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCG2P13521 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCG2P13521 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SCG2P13521 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCG2P13521 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCG2P13521 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCG2P13521 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCG2P13521 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCG2P13521 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SCG2P13521 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SCG2P13521 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
SCG2P13521 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SCG2P13521 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SCG2P13521 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SCG2P13521 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
SCG2P13521 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SCG2P13521 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SCG2P13521 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SCG2P13521 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SCG2P13521 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCG2P13521 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCG2P13521 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCG2P13521 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SCG2P13521 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCG2P13521 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCG2P13521 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SCG2P13521 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SCG2P13521 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SCG2P13521 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCG2P13521 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCG2P13521 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SCG2P13521 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SCG2P13521 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SCG2P13521 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SCG2P13521 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SCG2P13521 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SCG2P13521 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SCG2P13521 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SCG2P13521 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SCG2P13521 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SCG2P13521 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SCG2P13521 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCG2P13521 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCG2P13521 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCG2P13521 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCG2P13521 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCG2P13521 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCG2P13521 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCG2P13521 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCG2P13521 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCG2P13521 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCG2P13521 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCG2P13521 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCG2P13521 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCG2P13521 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCG2P13521 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCG2P13521 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCG2P13521 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCG2P13521 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCG2P13521 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCG2P13521 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCG2P13521 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCG2P13521 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCG2P13521 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCG2P13521 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCG2P13521 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCG2P13521 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCG2P13521 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCG2P13521 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCG2P13521 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCG2P13521 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCG2P13521 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCG2P13521 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCG2P13521 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCG2P13521 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCG2P13521 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCG2P13521 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCG2P13521 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCG2P13521 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCG2P13521 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCG2P13521 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCG2P13521 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCG2P13521 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCG2P13521 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCG2P13521 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCG2P13521 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCG2P13521 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCG2P13521 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCG2P13521 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCG2P13521 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCG2P13521 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCG2P13521 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.2 ms