Protein–RNA interactions for Protein: P11908

PRPS2, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPS2P11908 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPS2P11908 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPS2P11908 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPS2P11908 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPS2P11908 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPS2P11908 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPS2P11908 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPS2P11908 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPS2P11908 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPS2P11908 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPS2P11908 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPS2P11908 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPS2P11908 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPS2P11908 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPS2P11908 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPS2P11908 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPS2P11908 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPS2P11908 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPS2P11908 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPS2P11908 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPS2P11908 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPS2P11908 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPS2P11908 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPS2P11908 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPS2P11908 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPS2P11908 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPS2P11908 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPS2P11908 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPS2P11908 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPS2P11908 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPS2P11908 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPS2P11908 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPS2P11908 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPS2P11908 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PRPS2P11908 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPS2P11908 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPS2P11908 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPS2P11908 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPS2P11908 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPS2P11908 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPS2P11908 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPS2P11908 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPS2P11908 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPS2P11908 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPS2P11908 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPS2P11908 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPS2P11908 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPS2P11908 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPS2P11908 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPS2P11908 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPS2P11908 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPS2P11908 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPS2P11908 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPS2P11908 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPS2P11908 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPS2P11908 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPS2P11908 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPS2P11908 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPS2P11908 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPS2P11908 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPS2P11908 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPS2P11908 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPS2P11908 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPS2P11908 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPS2P11908 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPS2P11908 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPS2P11908 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPS2P11908 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPS2P11908 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPS2P11908 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPS2P11908 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPS2P11908 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPS2P11908 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPS2P11908 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPS2P11908 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPS2P11908 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPS2P11908 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPS2P11908 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPS2P11908 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPS2P11908 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPS2P11908 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPS2P11908 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPS2P11908 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPS2P11908 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPS2P11908 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPS2P11908 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPS2P11908 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPS2P11908 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPS2P11908 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPS2P11908 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPS2P11908 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPS2P11908 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPS2P11908 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPS2P11908 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPS2P11908 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPS2P11908 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPS2P11908 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPS2P11908 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPS2P11908 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPS2P11908 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.8 ms