Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DMDP11532 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DMDP11532 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DMDP11532 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DMDP11532 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DMDP11532 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DMDP11532 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DMDP11532 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DMDP11532 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DMDP11532 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DMDP11532 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DMDP11532 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DMDP11532 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DMDP11532 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DMDP11532 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DMDP11532 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DMDP11532 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DMDP11532 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DMDP11532 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DMDP11532 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DMDP11532 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DMDP11532 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DMDP11532 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DMDP11532 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DMDP11532 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DMDP11532 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DMDP11532 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DMDP11532 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DMDP11532 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DMDP11532 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DMDP11532 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DMDP11532 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DMDP11532 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DMDP11532 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DMDP11532 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DMDP11532 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DMDP11532 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DMDP11532 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DMDP11532 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DMDP11532 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DMDP11532 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DMDP11532 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DMDP11532 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DMDP11532 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
DMDP11532 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DMDP11532 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DMDP11532 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DMDP11532 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DMDP11532 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DMDP11532 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DMDP11532 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DMDP11532 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DMDP11532 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DMDP11532 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DMDP11532 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DMDP11532 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DMDP11532 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DMDP11532 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DMDP11532 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DMDP11532 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DMDP11532 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DMDP11532 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DMDP11532 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DMDP11532 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DMDP11532 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DMDP11532 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DMDP11532 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DMDP11532 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DMDP11532 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DMDP11532 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DMDP11532 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DMDP11532 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DMDP11532 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DMDP11532 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DMDP11532 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DMDP11532 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DMDP11532 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DMDP11532 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DMDP11532 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
DMDP11532 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DMDP11532 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DMDP11532 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DMDP11532 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
DMDP11532 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DMDP11532 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DMDP11532 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DMDP11532 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DMDP11532 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DMDP11532 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DMDP11532 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DMDP11532 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DMDP11532 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DMDP11532 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DMDP11532 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DMDP11532 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DMDP11532 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DMDP11532 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DMDP11532 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DMDP11532 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DMDP11532 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms