Protein–RNA interactions for Protein: P11229

CHRM1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM1P11229 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRM1P11229 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRM1P11229 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRM1P11229 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHRM1P11229 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHRM1P11229 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHRM1P11229 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHRM1P11229 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHRM1P11229 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHRM1P11229 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHRM1P11229 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHRM1P11229 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHRM1P11229 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CHRM1P11229 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRM1P11229 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRM1P11229 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRM1P11229 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRM1P11229 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRM1P11229 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRM1P11229 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRM1P11229 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRM1P11229 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRM1P11229 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRM1P11229 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRM1P11229 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRM1P11229 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRM1P11229 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRM1P11229 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRM1P11229 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRM1P11229 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRM1P11229 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRM1P11229 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRM1P11229 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRM1P11229 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRM1P11229 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRM1P11229 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRM1P11229 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRM1P11229 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRM1P11229 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRM1P11229 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRM1P11229 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRM1P11229 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRM1P11229 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRM1P11229 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRM1P11229 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRM1P11229 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRM1P11229 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRM1P11229 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRM1P11229 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRM1P11229 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRM1P11229 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRM1P11229 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRM1P11229 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRM1P11229 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRM1P11229 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRM1P11229 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRM1P11229 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRM1P11229 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRM1P11229 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRM1P11229 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRM1P11229 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRM1P11229 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRM1P11229 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRM1P11229 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRM1P11229 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRM1P11229 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRM1P11229 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRM1P11229 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRM1P11229 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRM1P11229 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRM1P11229 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRM1P11229 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRM1P11229 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRM1P11229 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRM1P11229 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRM1P11229 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRM1P11229 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRM1P11229 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRM1P11229 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRM1P11229 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRM1P11229 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRM1P11229 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRM1P11229 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRM1P11229 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRM1P11229 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRM1P11229 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRM1P11229 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRM1P11229 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRM1P11229 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRM1P11229 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRM1P11229 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRM1P11229 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRM1P11229 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRM1P11229 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRM1P11229 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRM1P11229 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRM1P11229 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRM1P11229 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRM1P11229 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHRM1P11229 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms