Protein–RNA interactions for Protein: P11171

EPB41, Protein 4.1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41P11171 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
EPB41P11171 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EPB41P11171 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EPB41P11171 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EPB41P11171 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EPB41P11171 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EPB41P11171 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EPB41P11171 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
EPB41P11171 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
EPB41P11171 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EPB41P11171 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EPB41P11171 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EPB41P11171 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
EPB41P11171 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EPB41P11171 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EPB41P11171 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EPB41P11171 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EPB41P11171 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
EPB41P11171 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
EPB41P11171 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
EPB41P11171 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EPB41P11171 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EPB41P11171 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EPB41P11171 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EPB41P11171 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EPB41P11171 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
EPB41P11171 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EPB41P11171 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EPB41P11171 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EPB41P11171 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EPB41P11171 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EPB41P11171 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EPB41P11171 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EPB41P11171 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EPB41P11171 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EPB41P11171 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EPB41P11171 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EPB41P11171 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EPB41P11171 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EPB41P11171 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EPB41P11171 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EPB41P11171 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EPB41P11171 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EPB41P11171 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
EPB41P11171 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EPB41P11171 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EPB41P11171 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EPB41P11171 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EPB41P11171 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EPB41P11171 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EPB41P11171 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EPB41P11171 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EPB41P11171 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
EPB41P11171 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EPB41P11171 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EPB41P11171 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EPB41P11171 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EPB41P11171 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EPB41P11171 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EPB41P11171 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EPB41P11171 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EPB41P11171 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EPB41P11171 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EPB41P11171 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
EPB41P11171 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
EPB41P11171 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EPB41P11171 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EPB41P11171 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EPB41P11171 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EPB41P11171 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EPB41P11171 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EPB41P11171 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EPB41P11171 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EPB41P11171 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EPB41P11171 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EPB41P11171 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EPB41P11171 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EPB41P11171 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EPB41P11171 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EPB41P11171 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EPB41P11171 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EPB41P11171 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EPB41P11171 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EPB41P11171 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EPB41P11171 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EPB41P11171 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EPB41P11171 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
EPB41P11171 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
EPB41P11171 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EPB41P11171 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EPB41P11171 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EPB41P11171 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EPB41P11171 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EPB41P11171 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EPB41P11171 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EPB41P11171 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EPB41P11171 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EPB41P11171 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EPB41P11171 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EPB41P11171 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms