Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Tnp1P10856 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Tnp1P10856 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Tnp1P10856 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Tnp1P10856 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Tnp1P10856 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tnp1P10856 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms