Protein–RNA interactions for Protein: P0DP58

LYNX1, Ly-6/neurotoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNX1P0DP58 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYNX1P0DP58 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYNX1P0DP58 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYNX1P0DP58 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYNX1P0DP58 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LYNX1P0DP58 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYNX1P0DP58 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYNX1P0DP58 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYNX1P0DP58 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYNX1P0DP58 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYNX1P0DP58 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYNX1P0DP58 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYNX1P0DP58 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYNX1P0DP58 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYNX1P0DP58 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYNX1P0DP58 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYNX1P0DP58 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYNX1P0DP58 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYNX1P0DP58 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYNX1P0DP58 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYNX1P0DP58 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LYNX1P0DP58 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LYNX1P0DP58 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LYNX1P0DP58 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LYNX1P0DP58 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LYNX1P0DP58 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LYNX1P0DP58 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LYNX1P0DP58 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LYNX1P0DP58 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LYNX1P0DP58 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LYNX1P0DP58 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LYNX1P0DP58 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LYNX1P0DP58 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LYNX1P0DP58 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LYNX1P0DP58 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LYNX1P0DP58 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LYNX1P0DP58 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LYNX1P0DP58 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LYNX1P0DP58 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LYNX1P0DP58 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LYNX1P0DP58 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LYNX1P0DP58 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LYNX1P0DP58 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LYNX1P0DP58 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LYNX1P0DP58 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LYNX1P0DP58 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LYNX1P0DP58 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LYNX1P0DP58 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LYNX1P0DP58 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LYNX1P0DP58 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LYNX1P0DP58 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LYNX1P0DP58 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LYNX1P0DP58 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LYNX1P0DP58 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LYNX1P0DP58 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LYNX1P0DP58 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LYNX1P0DP58 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LYNX1P0DP58 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYNX1P0DP58 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYNX1P0DP58 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYNX1P0DP58 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYNX1P0DP58 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYNX1P0DP58 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYNX1P0DP58 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYNX1P0DP58 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYNX1P0DP58 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYNX1P0DP58 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYNX1P0DP58 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LYNX1P0DP58 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LYNX1P0DP58 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LYNX1P0DP58 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LYNX1P0DP58 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LYNX1P0DP58 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LYNX1P0DP58 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LYNX1P0DP58 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LYNX1P0DP58 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LYNX1P0DP58 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LYNX1P0DP58 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LYNX1P0DP58 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LYNX1P0DP58 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LYNX1P0DP58 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LYNX1P0DP58 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LYNX1P0DP58 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LYNX1P0DP58 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LYNX1P0DP58 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LYNX1P0DP58 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LYNX1P0DP58 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LYNX1P0DP58 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LYNX1P0DP58 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LYNX1P0DP58 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LYNX1P0DP58 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LYNX1P0DP58 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LYNX1P0DP58 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LYNX1P0DP58 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LYNX1P0DP58 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LYNX1P0DP58 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LYNX1P0DP58 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LYNX1P0DP58 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LYNX1P0DP58 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LYNX1P0DP58 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms