Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATXN8OSP0DMR3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATXN8OSP0DMR3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATXN8OSP0DMR3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATXN8OSP0DMR3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATXN8OSP0DMR3 AC010181.2-201ENST00000483759 482 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATXN8OSP0DMR3 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATXN8OSP0DMR3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ATXN8OSP0DMR3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATXN8OSP0DMR3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATXN8OSP0DMR3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATXN8OSP0DMR3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATXN8OSP0DMR3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATXN8OSP0DMR3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATXN8OSP0DMR3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATXN8OSP0DMR3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATXN8OSP0DMR3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATXN8OSP0DMR3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATXN8OSP0DMR3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATXN8OSP0DMR3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATXN8OSP0DMR3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATXN8OSP0DMR3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATXN8OSP0DMR3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATXN8OSP0DMR3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATXN8OSP0DMR3 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATXN8OSP0DMR3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATXN8OSP0DMR3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ATXN8OSP0DMR3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATXN8OSP0DMR3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATXN8OSP0DMR3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATXN8OSP0DMR3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATXN8OSP0DMR3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATXN8OSP0DMR3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATXN8OSP0DMR3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATXN8OSP0DMR3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATXN8OSP0DMR3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATXN8OSP0DMR3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATXN8OSP0DMR3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATXN8OSP0DMR3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATXN8OSP0DMR3 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATXN8OSP0DMR3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATXN8OSP0DMR3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATXN8OSP0DMR3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATXN8OSP0DMR3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATXN8OSP0DMR3 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ATXN8OSP0DMR3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATXN8OSP0DMR3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATXN8OSP0DMR3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATXN8OSP0DMR3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATXN8OSP0DMR3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATXN8OSP0DMR3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATXN8OSP0DMR3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATXN8OSP0DMR3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATXN8OSP0DMR3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATXN8OSP0DMR3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATXN8OSP0DMR3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATXN8OSP0DMR3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATXN8OSP0DMR3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATXN8OSP0DMR3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATXN8OSP0DMR3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATXN8OSP0DMR3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATXN8OSP0DMR3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATXN8OSP0DMR3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATXN8OSP0DMR3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATXN8OSP0DMR3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATXN8OSP0DMR3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATXN8OSP0DMR3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATXN8OSP0DMR3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATXN8OSP0DMR3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATXN8OSP0DMR3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATXN8OSP0DMR3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATXN8OSP0DMR3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATXN8OSP0DMR3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATXN8OSP0DMR3 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ATXN8OSP0DMR3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATXN8OSP0DMR3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATXN8OSP0DMR3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATXN8OSP0DMR3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATXN8OSP0DMR3 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ATXN8OSP0DMR3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATXN8OSP0DMR3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATXN8OSP0DMR3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATXN8OSP0DMR3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATXN8OSP0DMR3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATXN8OSP0DMR3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATXN8OSP0DMR3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATXN8OSP0DMR3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATXN8OSP0DMR3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATXN8OSP0DMR3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATXN8OSP0DMR3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATXN8OSP0DMR3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATXN8OSP0DMR3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATXN8OSP0DMR3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATXN8OSP0DMR3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATXN8OSP0DMR3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATXN8OSP0DMR3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ATXN8OSP0DMR3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATXN8OSP0DMR3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATXN8OSP0DMR3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATXN8OSP0DMR3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms