Protein–RNA interactions for Protein: P0CB42

Alkbh1, Nucleic acid dioxygenase ALKBH1, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh1P0CB42 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Alkbh1P0CB42 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Alkbh1P0CB42 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Alkbh1P0CB42 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Alkbh1P0CB42 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Alkbh1P0CB42 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Alkbh1P0CB42 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Alkbh1P0CB42 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Alkbh1P0CB42 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Alkbh1P0CB42 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Alkbh1P0CB42 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Alkbh1P0CB42 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Alkbh1P0CB42 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Alkbh1P0CB42 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Alkbh1P0CB42 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Alkbh1P0CB42 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Alkbh1P0CB42 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Alkbh1P0CB42 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Alkbh1P0CB42 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Alkbh1P0CB42 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Alkbh1P0CB42 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Alkbh1P0CB42 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Alkbh1P0CB42 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Alkbh1P0CB42 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Alkbh1P0CB42 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Alkbh1P0CB42 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Alkbh1P0CB42 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Alkbh1P0CB42 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Alkbh1P0CB42 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Alkbh1P0CB42 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Alkbh1P0CB42 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Alkbh1P0CB42 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Alkbh1P0CB42 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Alkbh1P0CB42 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Alkbh1P0CB42 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Alkbh1P0CB42 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Alkbh1P0CB42 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Alkbh1P0CB42 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Alkbh1P0CB42 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Alkbh1P0CB42 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Alkbh1P0CB42 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Alkbh1P0CB42 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Alkbh1P0CB42 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Alkbh1P0CB42 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Alkbh1P0CB42 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Alkbh1P0CB42 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Alkbh1P0CB42 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Alkbh1P0CB42 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Alkbh1P0CB42 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Alkbh1P0CB42 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Alkbh1P0CB42 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Alkbh1P0CB42 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Alkbh1P0CB42 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Alkbh1P0CB42 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Alkbh1P0CB42 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Alkbh1P0CB42 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Alkbh1P0CB42 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Alkbh1P0CB42 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Alkbh1P0CB42 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Alkbh1P0CB42 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Alkbh1P0CB42 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Alkbh1P0CB42 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Alkbh1P0CB42 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Alkbh1P0CB42 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Alkbh1P0CB42 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Alkbh1P0CB42 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Alkbh1P0CB42 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Alkbh1P0CB42 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Alkbh1P0CB42 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Alkbh1P0CB42 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Alkbh1P0CB42 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Alkbh1P0CB42 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Alkbh1P0CB42 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Alkbh1P0CB42 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Alkbh1P0CB42 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Alkbh1P0CB42 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Alkbh1P0CB42 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Alkbh1P0CB42 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Alkbh1P0CB42 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Alkbh1P0CB42 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Alkbh1P0CB42 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Alkbh1P0CB42 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Alkbh1P0CB42 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Alkbh1P0CB42 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Alkbh1P0CB42 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Alkbh1P0CB42 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Alkbh1P0CB42 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Alkbh1P0CB42 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Alkbh1P0CB42 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Alkbh1P0CB42 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Alkbh1P0CB42 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Alkbh1P0CB42 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Alkbh1P0CB42 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Alkbh1P0CB42 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Alkbh1P0CB42 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Alkbh1P0CB42 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Alkbh1P0CB42 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Alkbh1P0CB42 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Alkbh1P0CB42 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Alkbh1P0CB42 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms