Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00032P0C843 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00032P0C843 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00032P0C843 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00032P0C843 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00032P0C843 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00032P0C843 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LINC00032P0C843 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00032P0C843 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00032P0C843 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00032P0C843 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00032P0C843 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00032P0C843 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00032P0C843 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00032P0C843 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00032P0C843 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00032P0C843 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00032P0C843 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00032P0C843 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00032P0C843 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00032P0C843 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00032P0C843 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00032P0C843 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00032P0C843 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00032P0C843 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00032P0C843 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00032P0C843 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00032P0C843 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00032P0C843 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00032P0C843 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00032P0C843 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00032P0C843 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00032P0C843 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00032P0C843 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00032P0C843 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00032P0C843 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00032P0C843 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00032P0C843 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00032P0C843 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00032P0C843 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00032P0C843 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00032P0C843 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00032P0C843 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00032P0C843 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC00032P0C843 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC00032P0C843 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC00032P0C843 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC00032P0C843 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC00032P0C843 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC00032P0C843 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC00032P0C843 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC00032P0C843 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00032P0C843 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00032P0C843 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00032P0C843 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00032P0C843 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00032P0C843 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00032P0C843 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00032P0C843 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00032P0C843 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00032P0C843 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00032P0C843 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00032P0C843 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LINC00032P0C843 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LINC00032P0C843 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00032P0C843 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00032P0C843 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LINC00032P0C843 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00032P0C843 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00032P0C843 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00032P0C843 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00032P0C843 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00032P0C843 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00032P0C843 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00032P0C843 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00032P0C843 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00032P0C843 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00032P0C843 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00032P0C843 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00032P0C843 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00032P0C843 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00032P0C843 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00032P0C843 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00032P0C843 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00032P0C843 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00032P0C843 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00032P0C843 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00032P0C843 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00032P0C843 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00032P0C843 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00032P0C843 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00032P0C843 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00032P0C843 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00032P0C843 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00032P0C843 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00032P0C843 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00032P0C843 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00032P0C843 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00032P0C843 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00032P0C843 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms