Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC172P0C7W6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC172P0C7W6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC172P0C7W6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC172P0C7W6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC172P0C7W6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC172P0C7W6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC172P0C7W6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC172P0C7W6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC172P0C7W6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC172P0C7W6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC172P0C7W6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC172P0C7W6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC172P0C7W6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC172P0C7W6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC172P0C7W6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC172P0C7W6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC172P0C7W6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC172P0C7W6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC172P0C7W6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC172P0C7W6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC172P0C7W6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC172P0C7W6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC172P0C7W6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC172P0C7W6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC172P0C7W6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC172P0C7W6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC172P0C7W6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC172P0C7W6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC172P0C7W6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC172P0C7W6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC172P0C7W6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC172P0C7W6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC172P0C7W6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC172P0C7W6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC172P0C7W6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC172P0C7W6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC172P0C7W6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC172P0C7W6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC172P0C7W6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC172P0C7W6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC172P0C7W6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC172P0C7W6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC172P0C7W6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC172P0C7W6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC172P0C7W6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC172P0C7W6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC172P0C7W6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC172P0C7W6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC172P0C7W6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC172P0C7W6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC172P0C7W6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC172P0C7W6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC172P0C7W6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC172P0C7W6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC172P0C7W6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC172P0C7W6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC172P0C7W6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC172P0C7W6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC172P0C7W6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC172P0C7W6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC172P0C7W6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC172P0C7W6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC172P0C7W6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC172P0C7W6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC172P0C7W6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC172P0C7W6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC172P0C7W6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC172P0C7W6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC172P0C7W6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC172P0C7W6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC172P0C7W6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC172P0C7W6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC172P0C7W6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC172P0C7W6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC172P0C7W6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC172P0C7W6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC172P0C7W6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC172P0C7W6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC172P0C7W6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC172P0C7W6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC172P0C7W6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC172P0C7W6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC172P0C7W6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC172P0C7W6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC172P0C7W6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC172P0C7W6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC172P0C7W6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC172P0C7W6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC172P0C7W6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC172P0C7W6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC172P0C7W6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC172P0C7W6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC172P0C7W6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC172P0C7W6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC172P0C7W6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC172P0C7W6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC172P0C7W6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC172P0C7W6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC172P0C7W6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms