Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd3P09027 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd3P09027 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd3P09027 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd3P09027 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd3P09027 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd3P09027 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd3P09027 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd3P09027 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd3P09027 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd3P09027 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd3P09027 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd3P09027 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd3P09027 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd3P09027 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd3P09027 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd3P09027 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd3P09027 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd3P09027 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd3P09027 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd3P09027 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd3P09027 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd3P09027 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd3P09027 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd3P09027 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd3P09027 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd3P09027 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd3P09027 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd3P09027 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd3P09027 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd3P09027 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd3P09027 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd3P09027 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd3P09027 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd3P09027 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd3P09027 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd3P09027 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd3P09027 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd3P09027 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd3P09027 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd3P09027 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd3P09027 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd3P09027 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd3P09027 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd3P09027 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd3P09027 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd3P09027 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd3P09027 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd3P09027 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd3P09027 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd3P09027 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd3P09027 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd3P09027 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd3P09027 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd3P09027 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd3P09027 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd3P09027 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd3P09027 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd3P09027 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd3P09027 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd3P09027 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd3P09027 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd3P09027 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd3P09027 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd3P09027 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd3P09027 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd3P09027 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd3P09027 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd3P09027 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd3P09027 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd3P09027 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Hoxd3P09027 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd3P09027 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd3P09027 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd3P09027 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd3P09027 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd3P09027 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd3P09027 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd3P09027 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd3P09027 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd3P09027 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd3P09027 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd3P09027 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd3P09027 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd3P09027 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd3P09027 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd3P09027 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd3P09027 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd3P09027 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd3P09027 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd3P09027 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd3P09027 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd3P09027 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd3P09027 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd3P09027 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd3P09027 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd3P09027 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd3P09027 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd3P09027 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd3P09027 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.8 ms