Protein–RNA interactions for Protein: P08775

Polr2a, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2aP08775 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Polr2aP08775 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Polr2aP08775 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Polr2aP08775 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Polr2aP08775 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Polr2aP08775 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Polr2aP08775 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Polr2aP08775 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Polr2aP08775 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Polr2aP08775 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Polr2aP08775 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Polr2aP08775 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Polr2aP08775 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Polr2aP08775 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Polr2aP08775 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Polr2aP08775 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Polr2aP08775 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Polr2aP08775 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Polr2aP08775 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Polr2aP08775 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Polr2aP08775 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Polr2aP08775 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Polr2aP08775 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Polr2aP08775 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Polr2aP08775 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Polr2aP08775 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Polr2aP08775 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Polr2aP08775 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Polr2aP08775 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Polr2aP08775 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Polr2aP08775 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Polr2aP08775 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Polr2aP08775 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Polr2aP08775 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Polr2aP08775 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Polr2aP08775 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Polr2aP08775 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Polr2aP08775 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Polr2aP08775 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Polr2aP08775 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Polr2aP08775 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Polr2aP08775 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Polr2aP08775 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Polr2aP08775 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Polr2aP08775 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Polr2aP08775 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Polr2aP08775 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Polr2aP08775 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Polr2aP08775 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Polr2aP08775 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Polr2aP08775 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Polr2aP08775 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Polr2aP08775 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Polr2aP08775 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Polr2aP08775 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Polr2aP08775 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Polr2aP08775 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Polr2aP08775 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Polr2aP08775 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Polr2aP08775 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Polr2aP08775 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Polr2aP08775 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Polr2aP08775 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Polr2aP08775 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Polr2aP08775 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Polr2aP08775 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Polr2aP08775 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Polr2aP08775 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Polr2aP08775 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Polr2aP08775 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Polr2aP08775 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Polr2aP08775 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Polr2aP08775 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Polr2aP08775 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Polr2aP08775 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Polr2aP08775 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Polr2aP08775 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Polr2aP08775 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Polr2aP08775 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Polr2aP08775 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Polr2aP08775 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Polr2aP08775 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Polr2aP08775 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Polr2aP08775 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Polr2aP08775 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Polr2aP08775 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Polr2aP08775 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Polr2aP08775 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Polr2aP08775 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Polr2aP08775 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Polr2aP08775 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Polr2aP08775 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Polr2aP08775 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Polr2aP08775 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Polr2aP08775 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Polr2aP08775 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Polr2aP08775 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Polr2aP08775 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Polr2aP08775 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Polr2aP08775 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.4 ms