Protein–RNA interactions for Protein: P08247

SYP, Synaptophysin, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPP08247 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYPP08247 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYPP08247 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYPP08247 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYPP08247 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SYPP08247 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYPP08247 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYPP08247 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYPP08247 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYPP08247 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYPP08247 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYPP08247 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYPP08247 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYPP08247 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYPP08247 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYPP08247 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SYPP08247 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYPP08247 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYPP08247 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYPP08247 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYPP08247 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYPP08247 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SYPP08247 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYPP08247 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYPP08247 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYPP08247 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYPP08247 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYPP08247 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYPP08247 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYPP08247 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYPP08247 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYPP08247 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYPP08247 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYPP08247 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYPP08247 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYPP08247 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYPP08247 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYPP08247 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SYPP08247 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYPP08247 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYPP08247 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYPP08247 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYPP08247 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYPP08247 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYPP08247 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYPP08247 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYPP08247 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYPP08247 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYPP08247 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYPP08247 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYPP08247 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SYPP08247 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYPP08247 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYPP08247 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYPP08247 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SYPP08247 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SYPP08247 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SYPP08247 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SYPP08247 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SYPP08247 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYPP08247 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYPP08247 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYPP08247 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYPP08247 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYPP08247 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYPP08247 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYPP08247 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYPP08247 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SYPP08247 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SYPP08247 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYPP08247 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYPP08247 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYPP08247 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYPP08247 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYPP08247 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYPP08247 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYPP08247 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYPP08247 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYPP08247 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYPP08247 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYPP08247 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SYPP08247 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYPP08247 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYPP08247 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SYPP08247 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYPP08247 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYPP08247 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYPP08247 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYPP08247 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYPP08247 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYPP08247 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYPP08247 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYPP08247 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYPP08247 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYPP08247 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYPP08247 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYPP08247 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYPP08247 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYPP08247 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYPP08247 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms