Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TtrP07309 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TtrP07309 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TtrP07309 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TtrP07309 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TtrP07309 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TtrP07309 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TtrP07309 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TtrP07309 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TtrP07309 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TtrP07309 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TtrP07309 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TtrP07309 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TtrP07309 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TtrP07309 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TtrP07309 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TtrP07309 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TtrP07309 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TtrP07309 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TtrP07309 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TtrP07309 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TtrP07309 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TtrP07309 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TtrP07309 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TtrP07309 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TtrP07309 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TtrP07309 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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TtrP07309 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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TtrP07309 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TtrP07309 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TtrP07309 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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TtrP07309 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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TtrP07309 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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TtrP07309 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TtrP07309 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TtrP07309 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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TtrP07309 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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TtrP07309 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TtrP07309 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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TtrP07309 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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TtrP07309 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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TtrP07309 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TtrP07309 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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TtrP07309 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TtrP07309 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TtrP07309 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TtrP07309 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TtrP07309 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TtrP07309 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TtrP07309 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TtrP07309 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TtrP07309 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TtrP07309 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TtrP07309 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TtrP07309 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TtrP07309 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TtrP07309 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TtrP07309 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TtrP07309 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TtrP07309 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TtrP07309 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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