Protein–RNA interactions for Protein: P05771

PRKCB, Protein kinase C beta type, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCBP05771 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKCBP05771 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKCBP05771 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKCBP05771 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKCBP05771 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKCBP05771 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKCBP05771 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKCBP05771 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKCBP05771 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKCBP05771 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKCBP05771 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKCBP05771 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKCBP05771 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKCBP05771 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKCBP05771 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKCBP05771 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKCBP05771 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKCBP05771 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKCBP05771 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKCBP05771 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRKCBP05771 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRKCBP05771 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRKCBP05771 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRKCBP05771 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRKCBP05771 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRKCBP05771 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRKCBP05771 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRKCBP05771 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRKCBP05771 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRKCBP05771 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRKCBP05771 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKCBP05771 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKCBP05771 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKCBP05771 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKCBP05771 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKCBP05771 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKCBP05771 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKCBP05771 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKCBP05771 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKCBP05771 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKCBP05771 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKCBP05771 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKCBP05771 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKCBP05771 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKCBP05771 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKCBP05771 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKCBP05771 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKCBP05771 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKCBP05771 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKCBP05771 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKCBP05771 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKCBP05771 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKCBP05771 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKCBP05771 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKCBP05771 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKCBP05771 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKCBP05771 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKCBP05771 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKCBP05771 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRKCBP05771 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRKCBP05771 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRKCBP05771 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRKCBP05771 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRKCBP05771 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRKCBP05771 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRKCBP05771 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRKCBP05771 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRKCBP05771 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRKCBP05771 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRKCBP05771 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRKCBP05771 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRKCBP05771 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRKCBP05771 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRKCBP05771 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRKCBP05771 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRKCBP05771 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKCBP05771 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKCBP05771 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKCBP05771 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKCBP05771 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKCBP05771 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKCBP05771 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRKCBP05771 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRKCBP05771 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRKCBP05771 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRKCBP05771 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRKCBP05771 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRKCBP05771 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRKCBP05771 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRKCBP05771 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRKCBP05771 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRKCBP05771 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRKCBP05771 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRKCBP05771 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRKCBP05771 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRKCBP05771 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRKCBP05771 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRKCBP05771 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRKCBP05771 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRKCBP05771 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.1 ms