Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APODP05090 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APODP05090 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APODP05090 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APODP05090 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
APODP05090 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APODP05090 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APODP05090 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APODP05090 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APODP05090 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APODP05090 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APODP05090 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
APODP05090 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APODP05090 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APODP05090 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APODP05090 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APODP05090 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APODP05090 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APODP05090 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APODP05090 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APODP05090 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APODP05090 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APODP05090 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APODP05090 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APODP05090 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
APODP05090 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
APODP05090 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APODP05090 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APODP05090 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APODP05090 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APODP05090 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APODP05090 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APODP05090 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APODP05090 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APODP05090 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APODP05090 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APODP05090 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APODP05090 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APODP05090 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
APODP05090 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APODP05090 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APODP05090 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APODP05090 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APODP05090 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APODP05090 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APODP05090 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APODP05090 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APODP05090 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APODP05090 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APODP05090 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APODP05090 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APODP05090 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APODP05090 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APODP05090 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APODP05090 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APODP05090 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APODP05090 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APODP05090 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APODP05090 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APODP05090 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APODP05090 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APODP05090 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APODP05090 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APODP05090 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APODP05090 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APODP05090 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APODP05090 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APODP05090 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
APODP05090 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APODP05090 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APODP05090 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APODP05090 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APODP05090 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APODP05090 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
APODP05090 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APODP05090 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
APODP05090 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APODP05090 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APODP05090 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APODP05090 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APODP05090 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APODP05090 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APODP05090 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
APODP05090 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APODP05090 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
APODP05090 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APODP05090 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APODP05090 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APODP05090 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APODP05090 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APODP05090 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APODP05090 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APODP05090 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
APODP05090 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
APODP05090 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
APODP05090 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
APODP05090 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APODP05090 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APODP05090 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APODP05090 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms