Protein–RNA interactions for Protein: P04183

TK1, Thymidine kinase, cytosolic, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK1P04183 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TK1P04183 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TK1P04183 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TK1P04183 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TK1P04183 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TK1P04183 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TK1P04183 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TK1P04183 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TK1P04183 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.2■□□□□ 0.83
TK1P04183 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TK1P04183 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TK1P04183 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TK1P04183 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TK1P04183 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TK1P04183 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TK1P04183 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TK1P04183 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TK1P04183 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TK1P04183 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TK1P04183 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TK1P04183 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TK1P04183 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TK1P04183 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TK1P04183 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TK1P04183 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TK1P04183 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TK1P04183 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TK1P04183 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TK1P04183 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TK1P04183 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TK1P04183 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TK1P04183 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TK1P04183 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TK1P04183 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TK1P04183 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TK1P04183 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TK1P04183 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TK1P04183 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TK1P04183 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TK1P04183 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TK1P04183 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TK1P04183 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TK1P04183 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TK1P04183 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TK1P04183 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TK1P04183 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TK1P04183 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TK1P04183 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TK1P04183 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TK1P04183 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TK1P04183 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TK1P04183 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TK1P04183 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TK1P04183 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TK1P04183 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TK1P04183 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TK1P04183 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TK1P04183 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TK1P04183 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TK1P04183 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TK1P04183 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TK1P04183 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TK1P04183 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TK1P04183 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TK1P04183 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TK1P04183 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TK1P04183 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TK1P04183 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TK1P04183 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TK1P04183 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TK1P04183 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TK1P04183 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TK1P04183 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TK1P04183 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TK1P04183 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TK1P04183 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TK1P04183 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TK1P04183 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TK1P04183 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TK1P04183 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TK1P04183 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TK1P04183 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TK1P04183 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TK1P04183 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TK1P04183 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TK1P04183 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TK1P04183 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TK1P04183 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TK1P04183 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TK1P04183 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TK1P04183 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TK1P04183 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TK1P04183 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TK1P04183 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TK1P04183 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TK1P04183 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TK1P04183 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TK1P04183 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TK1P04183 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TK1P04183 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.5 ms