Protein–RNA interactions for Protein: P02340

Tp53, Cellular tumor antigen p53, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53P02340 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tp53P02340 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tp53P02340 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tp53P02340 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tp53P02340 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tp53P02340 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tp53P02340 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tp53P02340 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tp53P02340 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tp53P02340 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tp53P02340 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tp53P02340 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tp53P02340 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tp53P02340 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tp53P02340 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tp53P02340 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tp53P02340 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tp53P02340 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tp53P02340 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tp53P02340 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tp53P02340 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tp53P02340 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tp53P02340 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tp53P02340 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tp53P02340 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tp53P02340 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tp53P02340 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tp53P02340 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tp53P02340 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tp53P02340 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tp53P02340 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tp53P02340 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tp53P02340 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tp53P02340 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tp53P02340 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tp53P02340 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tp53P02340 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tp53P02340 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tp53P02340 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tp53P02340 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tp53P02340 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tp53P02340 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tp53P02340 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tp53P02340 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tp53P02340 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tp53P02340 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tp53P02340 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tp53P02340 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tp53P02340 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tp53P02340 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tp53P02340 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tp53P02340 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tp53P02340 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tp53P02340 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tp53P02340 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tp53P02340 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tp53P02340 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tp53P02340 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tp53P02340 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tp53P02340 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tp53P02340 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tp53P02340 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tp53P02340 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tp53P02340 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tp53P02340 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tp53P02340 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tp53P02340 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tp53P02340 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tp53P02340 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tp53P02340 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tp53P02340 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tp53P02340 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tp53P02340 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Tp53P02340 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tp53P02340 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tp53P02340 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Tp53P02340 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tp53P02340 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tp53P02340 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tp53P02340 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tp53P02340 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tp53P02340 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tp53P02340 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tp53P02340 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Tp53P02340 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tp53P02340 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tp53P02340 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tp53P02340 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tp53P02340 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tp53P02340 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tp53P02340 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tp53P02340 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tp53P02340 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tp53P02340 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tp53P02340 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tp53P02340 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tp53P02340 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tp53P02340 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tp53P02340 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tp53P02340 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms