Protein–RNA interactions for Protein: P01631

Ig kappa chain V-II region 26-10, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01631 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P01631 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
P01631 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
P01631 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
P01631 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
P01631 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
P01631 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
P01631 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
P01631 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
P01631 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P01631 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P01631 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P01631 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P01631 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P01631 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
P01631 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
P01631 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P01631 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P01631 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01631 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01631 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01631 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01631 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01631 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01631 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01631 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01631 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01631 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01631 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01631 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01631 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01631 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
P01631 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01631 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
P01631 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01631 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
P01631 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
P01631 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01631 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01631 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01631 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01631 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01631 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01631 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01631 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01631 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01631 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01631 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01631 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01631 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01631 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01631 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P01631 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P01631 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P01631 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P01631 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P01631 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
P01631 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P01631 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P01631 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P01631 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
P01631 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P01631 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P01631 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P01631 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P01631 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P01631 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
P01631 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
P01631 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
P01631 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P01631 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P01631 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
P01631 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
P01631 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
P01631 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
P01631 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
P01631 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01631 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01631 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01631 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01631 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01631 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01631 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01631 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
P01631 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
P01631 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
P01631 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
P01631 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01631 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01631 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01631 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01631 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01631 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01631 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01631 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01631 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01631 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01631 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01631 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01631 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.4 ms