Protein–RNA interactions for Protein: O95777

LSM8, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM8O95777 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LSM8O95777 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LSM8O95777 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LSM8O95777 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LSM8O95777 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LSM8O95777 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LSM8O95777 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LSM8O95777 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LSM8O95777 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LSM8O95777 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LSM8O95777 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LSM8O95777 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LSM8O95777 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LSM8O95777 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LSM8O95777 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LSM8O95777 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LSM8O95777 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LSM8O95777 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LSM8O95777 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LSM8O95777 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LSM8O95777 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LSM8O95777 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LSM8O95777 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LSM8O95777 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LSM8O95777 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LSM8O95777 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LSM8O95777 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LSM8O95777 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LSM8O95777 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LSM8O95777 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LSM8O95777 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LSM8O95777 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LSM8O95777 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LSM8O95777 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LSM8O95777 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LSM8O95777 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LSM8O95777 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LSM8O95777 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LSM8O95777 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LSM8O95777 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LSM8O95777 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LSM8O95777 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LSM8O95777 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LSM8O95777 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LSM8O95777 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LSM8O95777 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LSM8O95777 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LSM8O95777 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LSM8O95777 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LSM8O95777 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LSM8O95777 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LSM8O95777 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LSM8O95777 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LSM8O95777 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LSM8O95777 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LSM8O95777 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LSM8O95777 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LSM8O95777 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LSM8O95777 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LSM8O95777 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LSM8O95777 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LSM8O95777 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LSM8O95777 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LSM8O95777 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LSM8O95777 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LSM8O95777 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LSM8O95777 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LSM8O95777 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LSM8O95777 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LSM8O95777 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LSM8O95777 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LSM8O95777 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LSM8O95777 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LSM8O95777 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LSM8O95777 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LSM8O95777 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LSM8O95777 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LSM8O95777 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LSM8O95777 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LSM8O95777 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LSM8O95777 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LSM8O95777 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LSM8O95777 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LSM8O95777 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LSM8O95777 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LSM8O95777 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LSM8O95777 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LSM8O95777 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LSM8O95777 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LSM8O95777 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LSM8O95777 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LSM8O95777 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LSM8O95777 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LSM8O95777 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LSM8O95777 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LSM8O95777 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LSM8O95777 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LSM8O95777 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LSM8O95777 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LSM8O95777 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms