Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOL3O95236 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOL3O95236 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOL3O95236 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOL3O95236 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOL3O95236 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOL3O95236 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOL3O95236 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOL3O95236 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOL3O95236 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOL3O95236 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOL3O95236 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOL3O95236 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOL3O95236 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
APOL3O95236 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
APOL3O95236 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
APOL3O95236 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
APOL3O95236 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
APOL3O95236 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
APOL3O95236 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
APOL3O95236 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
APOL3O95236 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
APOL3O95236 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOL3O95236 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOL3O95236 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOL3O95236 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOL3O95236 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOL3O95236 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOL3O95236 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOL3O95236 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
APOL3O95236 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOL3O95236 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOL3O95236 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOL3O95236 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOL3O95236 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOL3O95236 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOL3O95236 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOL3O95236 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOL3O95236 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOL3O95236 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
APOL3O95236 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOL3O95236 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOL3O95236 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOL3O95236 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOL3O95236 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOL3O95236 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOL3O95236 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOL3O95236 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOL3O95236 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOL3O95236 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
APOL3O95236 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOL3O95236 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOL3O95236 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOL3O95236 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOL3O95236 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOL3O95236 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOL3O95236 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOL3O95236 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOL3O95236 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOL3O95236 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOL3O95236 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOL3O95236 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOL3O95236 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOL3O95236 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOL3O95236 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
APOL3O95236 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOL3O95236 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOL3O95236 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOL3O95236 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOL3O95236 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOL3O95236 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOL3O95236 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOL3O95236 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOL3O95236 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOL3O95236 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOL3O95236 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOL3O95236 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOL3O95236 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOL3O95236 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOL3O95236 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOL3O95236 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOL3O95236 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOL3O95236 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOL3O95236 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOL3O95236 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOL3O95236 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOL3O95236 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOL3O95236 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOL3O95236 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOL3O95236 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOL3O95236 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOL3O95236 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOL3O95236 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOL3O95236 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOL3O95236 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOL3O95236 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOL3O95236 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOL3O95236 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOL3O95236 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
APOL3O95236 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms