Protein–RNA interactions for Protein: O94993

SOX30, Transcription factor SOX-30, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX30O94993 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX30O94993 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX30O94993 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX30O94993 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX30O94993 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX30O94993 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX30O94993 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX30O94993 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX30O94993 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX30O94993 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX30O94993 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX30O94993 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX30O94993 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX30O94993 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX30O94993 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX30O94993 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX30O94993 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX30O94993 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX30O94993 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX30O94993 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SOX30O94993 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX30O94993 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX30O94993 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX30O94993 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX30O94993 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX30O94993 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX30O94993 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX30O94993 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX30O94993 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX30O94993 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX30O94993 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX30O94993 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX30O94993 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX30O94993 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX30O94993 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX30O94993 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX30O94993 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX30O94993 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX30O94993 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX30O94993 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX30O94993 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX30O94993 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX30O94993 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX30O94993 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX30O94993 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX30O94993 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX30O94993 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX30O94993 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX30O94993 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX30O94993 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX30O94993 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX30O94993 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX30O94993 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX30O94993 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX30O94993 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX30O94993 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX30O94993 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX30O94993 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX30O94993 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX30O94993 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX30O94993 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX30O94993 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX30O94993 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX30O94993 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX30O94993 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX30O94993 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX30O94993 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX30O94993 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX30O94993 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX30O94993 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX30O94993 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX30O94993 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX30O94993 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX30O94993 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX30O94993 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX30O94993 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX30O94993 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX30O94993 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX30O94993 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX30O94993 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX30O94993 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX30O94993 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX30O94993 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX30O94993 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX30O94993 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX30O94993 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX30O94993 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX30O94993 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX30O94993 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX30O94993 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX30O94993 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX30O94993 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX30O94993 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX30O94993 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX30O94993 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX30O94993 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX30O94993 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX30O94993 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX30O94993 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX30O94993 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms