Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBXN7O94888 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN7O94888 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN7O94888 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN7O94888 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN7O94888 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN7O94888 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN7O94888 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN7O94888 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN7O94888 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN7O94888 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBXN7O94888 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBXN7O94888 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBXN7O94888 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBXN7O94888 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBXN7O94888 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBXN7O94888 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBXN7O94888 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBXN7O94888 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
UBXN7O94888 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBXN7O94888 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBXN7O94888 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBXN7O94888 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBXN7O94888 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBXN7O94888 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBXN7O94888 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBXN7O94888 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBXN7O94888 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBXN7O94888 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBXN7O94888 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
UBXN7O94888 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBXN7O94888 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBXN7O94888 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBXN7O94888 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBXN7O94888 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBXN7O94888 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBXN7O94888 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBXN7O94888 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBXN7O94888 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBXN7O94888 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBXN7O94888 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBXN7O94888 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBXN7O94888 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBXN7O94888 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBXN7O94888 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBXN7O94888 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
UBXN7O94888 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBXN7O94888 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBXN7O94888 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBXN7O94888 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBXN7O94888 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBXN7O94888 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBXN7O94888 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBXN7O94888 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBXN7O94888 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBXN7O94888 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBXN7O94888 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBXN7O94888 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBXN7O94888 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
UBXN7O94888 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBXN7O94888 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBXN7O94888 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBXN7O94888 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBXN7O94888 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBXN7O94888 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBXN7O94888 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBXN7O94888 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN7O94888 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN7O94888 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN7O94888 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN7O94888 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN7O94888 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN7O94888 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN7O94888 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN7O94888 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN7O94888 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN7O94888 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
UBXN7O94888 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBXN7O94888 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBXN7O94888 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBXN7O94888 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBXN7O94888 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBXN7O94888 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBXN7O94888 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBXN7O94888 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBXN7O94888 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBXN7O94888 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBXN7O94888 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBXN7O94888 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBXN7O94888 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBXN7O94888 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBXN7O94888 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBXN7O94888 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBXN7O94888 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBXN7O94888 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBXN7O94888 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBXN7O94888 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBXN7O94888 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBXN7O94888 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBXN7O94888 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms