Protein–RNA interactions for Protein: O94876

TMCC1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC1O94876 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMCC1O94876 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMCC1O94876 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMCC1O94876 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMCC1O94876 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMCC1O94876 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMCC1O94876 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMCC1O94876 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMCC1O94876 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMCC1O94876 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMCC1O94876 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMCC1O94876 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMCC1O94876 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMCC1O94876 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMCC1O94876 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMCC1O94876 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMCC1O94876 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMCC1O94876 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMCC1O94876 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMCC1O94876 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMCC1O94876 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMCC1O94876 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMCC1O94876 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMCC1O94876 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMCC1O94876 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMCC1O94876 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMCC1O94876 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMCC1O94876 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMCC1O94876 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMCC1O94876 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMCC1O94876 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMCC1O94876 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMCC1O94876 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMCC1O94876 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMCC1O94876 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMCC1O94876 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMCC1O94876 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMCC1O94876 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMCC1O94876 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMCC1O94876 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMCC1O94876 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TMCC1O94876 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMCC1O94876 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMCC1O94876 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMCC1O94876 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TMCC1O94876 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMCC1O94876 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMCC1O94876 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMCC1O94876 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMCC1O94876 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMCC1O94876 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMCC1O94876 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMCC1O94876 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TMCC1O94876 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMCC1O94876 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TMCC1O94876 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMCC1O94876 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMCC1O94876 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMCC1O94876 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TMCC1O94876 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMCC1O94876 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMCC1O94876 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMCC1O94876 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMCC1O94876 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMCC1O94876 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMCC1O94876 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TMCC1O94876 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMCC1O94876 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMCC1O94876 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMCC1O94876 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMCC1O94876 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMCC1O94876 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMCC1O94876 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMCC1O94876 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TMCC1O94876 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TMCC1O94876 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMCC1O94876 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMCC1O94876 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMCC1O94876 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMCC1O94876 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMCC1O94876 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMCC1O94876 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMCC1O94876 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMCC1O94876 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMCC1O94876 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMCC1O94876 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMCC1O94876 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMCC1O94876 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMCC1O94876 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMCC1O94876 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMCC1O94876 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMCC1O94876 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMCC1O94876 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMCC1O94876 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMCC1O94876 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMCC1O94876 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMCC1O94876 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMCC1O94876 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMCC1O94876 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMCC1O94876 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.9 ms