Protein–RNA interactions for Protein: O88824

Jtb, Protein JTB, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JtbO88824 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
JtbO88824 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
JtbO88824 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
JtbO88824 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
JtbO88824 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
JtbO88824 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
JtbO88824 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
JtbO88824 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
JtbO88824 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
JtbO88824 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
JtbO88824 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
JtbO88824 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
JtbO88824 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
JtbO88824 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
JtbO88824 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
JtbO88824 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
JtbO88824 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
JtbO88824 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
JtbO88824 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
JtbO88824 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
JtbO88824 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
JtbO88824 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
JtbO88824 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
JtbO88824 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
JtbO88824 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
JtbO88824 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
JtbO88824 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
JtbO88824 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
JtbO88824 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
JtbO88824 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
JtbO88824 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
JtbO88824 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
JtbO88824 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
JtbO88824 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
JtbO88824 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
JtbO88824 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
JtbO88824 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
JtbO88824 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
JtbO88824 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
JtbO88824 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
JtbO88824 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
JtbO88824 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
JtbO88824 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
JtbO88824 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
JtbO88824 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
JtbO88824 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
JtbO88824 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
JtbO88824 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
JtbO88824 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
JtbO88824 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
JtbO88824 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
JtbO88824 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
JtbO88824 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
JtbO88824 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
JtbO88824 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
JtbO88824 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
JtbO88824 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
JtbO88824 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
JtbO88824 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
JtbO88824 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
JtbO88824 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
JtbO88824 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
JtbO88824 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
JtbO88824 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
JtbO88824 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
JtbO88824 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
JtbO88824 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
JtbO88824 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
JtbO88824 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
JtbO88824 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
JtbO88824 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
JtbO88824 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
JtbO88824 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
JtbO88824 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
JtbO88824 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
JtbO88824 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
JtbO88824 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
JtbO88824 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
JtbO88824 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
JtbO88824 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
JtbO88824 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
JtbO88824 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
JtbO88824 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
JtbO88824 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
JtbO88824 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
JtbO88824 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
JtbO88824 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
JtbO88824 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
JtbO88824 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
JtbO88824 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
JtbO88824 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
JtbO88824 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
JtbO88824 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
JtbO88824 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
JtbO88824 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
JtbO88824 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
JtbO88824 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
JtbO88824 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
JtbO88824 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
JtbO88824 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.6 ms