Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
BlmO88700 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
BlmO88700 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
BlmO88700 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
BlmO88700 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
BlmO88700 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
BlmO88700 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
BlmO88700 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
BlmO88700 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
BlmO88700 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
BlmO88700 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
BlmO88700 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
BlmO88700 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
BlmO88700 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
BlmO88700 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
BlmO88700 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
BlmO88700 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
BlmO88700 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
BlmO88700 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
BlmO88700 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
BlmO88700 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
BlmO88700 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
BlmO88700 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
BlmO88700 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
BlmO88700 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
BlmO88700 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
BlmO88700 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
BlmO88700 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
BlmO88700 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
BlmO88700 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
BlmO88700 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
BlmO88700 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
BlmO88700 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
BlmO88700 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
BlmO88700 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
BlmO88700 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
BlmO88700 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
BlmO88700 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
BlmO88700 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
BlmO88700 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
BlmO88700 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
BlmO88700 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
BlmO88700 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
BlmO88700 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
BlmO88700 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
BlmO88700 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
BlmO88700 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
BlmO88700 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
BlmO88700 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
BlmO88700 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
BlmO88700 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
BlmO88700 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
BlmO88700 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
BlmO88700 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
BlmO88700 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
BlmO88700 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
BlmO88700 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
BlmO88700 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
BlmO88700 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
BlmO88700 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
BlmO88700 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
BlmO88700 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
BlmO88700 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
BlmO88700 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
BlmO88700 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
BlmO88700 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
BlmO88700 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
BlmO88700 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
BlmO88700 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
BlmO88700 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
BlmO88700 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
BlmO88700 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
BlmO88700 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
BlmO88700 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
BlmO88700 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
BlmO88700 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
BlmO88700 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
BlmO88700 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
BlmO88700 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
BlmO88700 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
BlmO88700 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
BlmO88700 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
BlmO88700 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
BlmO88700 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
BlmO88700 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
BlmO88700 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
BlmO88700 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
BlmO88700 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
BlmO88700 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
BlmO88700 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
BlmO88700 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
BlmO88700 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
BlmO88700 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
BlmO88700 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
BlmO88700 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
BlmO88700 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
BlmO88700 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
BlmO88700 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
BlmO88700 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
BlmO88700 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms