Protein–RNA interactions for Protein: O88552

Cldn2, Claudin-2, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn2O88552 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn2O88552 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn2O88552 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cldn2O88552 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cldn2O88552 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cldn2O88552 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cldn2O88552 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn2O88552 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn2O88552 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn2O88552 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn2O88552 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn2O88552 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn2O88552 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn2O88552 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn2O88552 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn2O88552 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn2O88552 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn2O88552 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn2O88552 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn2O88552 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn2O88552 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn2O88552 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn2O88552 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn2O88552 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn2O88552 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn2O88552 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn2O88552 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn2O88552 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn2O88552 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn2O88552 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn2O88552 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn2O88552 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn2O88552 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn2O88552 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn2O88552 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn2O88552 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn2O88552 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn2O88552 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn2O88552 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn2O88552 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn2O88552 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn2O88552 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn2O88552 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn2O88552 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn2O88552 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn2O88552 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn2O88552 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn2O88552 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn2O88552 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn2O88552 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn2O88552 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn2O88552 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn2O88552 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn2O88552 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cldn2O88552 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cldn2O88552 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cldn2O88552 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cldn2O88552 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cldn2O88552 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldn2O88552 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldn2O88552 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldn2O88552 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldn2O88552 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldn2O88552 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldn2O88552 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldn2O88552 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn2O88552 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn2O88552 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn2O88552 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn2O88552 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn2O88552 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn2O88552 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldn2O88552 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldn2O88552 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldn2O88552 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldn2O88552 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldn2O88552 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldn2O88552 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldn2O88552 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldn2O88552 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldn2O88552 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cldn2O88552 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cldn2O88552 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cldn2O88552 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cldn2O88552 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cldn2O88552 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cldn2O88552 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldn2O88552 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldn2O88552 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldn2O88552 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldn2O88552 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldn2O88552 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldn2O88552 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldn2O88552 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldn2O88552 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cldn2O88552 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cldn2O88552 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cldn2O88552 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cldn2O88552 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldn2O88552 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.7 ms