Protein–RNA interactions for Protein: O60810

PRAMEF4, PRAME family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF4O60810 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF4O60810 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF4O60810 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF4O60810 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF4O60810 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF4O60810 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF4O60810 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF4O60810 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF4O60810 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF4O60810 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF4O60810 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF4O60810 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF4O60810 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF4O60810 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF4O60810 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF4O60810 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF4O60810 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF4O60810 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF4O60810 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF4O60810 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF4O60810 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF4O60810 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF4O60810 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF4O60810 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF4O60810 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF4O60810 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF4O60810 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF4O60810 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF4O60810 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF4O60810 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF4O60810 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF4O60810 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF4O60810 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF4O60810 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF4O60810 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF4O60810 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF4O60810 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF4O60810 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF4O60810 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF4O60810 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF4O60810 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF4O60810 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF4O60810 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF4O60810 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF4O60810 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF4O60810 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF4O60810 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF4O60810 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF4O60810 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF4O60810 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF4O60810 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF4O60810 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF4O60810 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF4O60810 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF4O60810 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF4O60810 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF4O60810 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF4O60810 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF4O60810 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF4O60810 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF4O60810 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF4O60810 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF4O60810 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF4O60810 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF4O60810 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF4O60810 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF4O60810 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF4O60810 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF4O60810 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF4O60810 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF4O60810 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF4O60810 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF4O60810 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF4O60810 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF4O60810 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF4O60810 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF4O60810 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF4O60810 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF4O60810 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF4O60810 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF4O60810 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF4O60810 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF4O60810 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF4O60810 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF4O60810 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF4O60810 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF4O60810 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF4O60810 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF4O60810 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF4O60810 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF4O60810 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF4O60810 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF4O60810 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF4O60810 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF4O60810 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF4O60810 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF4O60810 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF4O60810 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF4O60810 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF4O60810 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms