Protein–RNA interactions for Protein: O60636

TSPAN2, Tetraspanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN2O60636 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN2O60636 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN2O60636 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN2O60636 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN2O60636 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN2O60636 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN2O60636 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN2O60636 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN2O60636 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN2O60636 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN2O60636 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN2O60636 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN2O60636 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN2O60636 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN2O60636 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN2O60636 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN2O60636 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN2O60636 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN2O60636 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN2O60636 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN2O60636 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN2O60636 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN2O60636 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN2O60636 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN2O60636 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN2O60636 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN2O60636 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN2O60636 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN2O60636 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN2O60636 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN2O60636 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN2O60636 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN2O60636 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN2O60636 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN2O60636 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN2O60636 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN2O60636 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN2O60636 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN2O60636 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN2O60636 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN2O60636 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN2O60636 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN2O60636 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN2O60636 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN2O60636 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN2O60636 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN2O60636 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN2O60636 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN2O60636 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN2O60636 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN2O60636 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN2O60636 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN2O60636 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN2O60636 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN2O60636 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN2O60636 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN2O60636 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN2O60636 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN2O60636 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN2O60636 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN2O60636 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN2O60636 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN2O60636 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN2O60636 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN2O60636 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN2O60636 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN2O60636 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TSPAN2O60636 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TSPAN2O60636 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TSPAN2O60636 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSPAN2O60636 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSPAN2O60636 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSPAN2O60636 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSPAN2O60636 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN2O60636 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN2O60636 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN2O60636 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN2O60636 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN2O60636 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN2O60636 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN2O60636 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN2O60636 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN2O60636 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN2O60636 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN2O60636 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN2O60636 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN2O60636 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN2O60636 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN2O60636 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN2O60636 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN2O60636 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN2O60636 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN2O60636 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN2O60636 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN2O60636 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN2O60636 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN2O60636 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN2O60636 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN2O60636 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN2O60636 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms