Protein–RNA interactions for Protein: O60613

SELENOF, Selenoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOFO60613 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SELENOFO60613 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SELENOFO60613 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SELENOFO60613 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SELENOFO60613 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SELENOFO60613 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SELENOFO60613 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SELENOFO60613 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SELENOFO60613 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SELENOFO60613 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SELENOFO60613 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SELENOFO60613 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SELENOFO60613 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SELENOFO60613 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SELENOFO60613 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SELENOFO60613 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SELENOFO60613 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SELENOFO60613 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SELENOFO60613 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SELENOFO60613 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SELENOFO60613 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SELENOFO60613 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SELENOFO60613 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SELENOFO60613 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SELENOFO60613 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SELENOFO60613 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SELENOFO60613 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SELENOFO60613 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SELENOFO60613 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SELENOFO60613 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SELENOFO60613 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SELENOFO60613 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SELENOFO60613 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SELENOFO60613 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SELENOFO60613 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SELENOFO60613 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SELENOFO60613 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SELENOFO60613 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SELENOFO60613 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SELENOFO60613 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SELENOFO60613 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SELENOFO60613 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SELENOFO60613 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SELENOFO60613 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SELENOFO60613 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SELENOFO60613 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SELENOFO60613 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SELENOFO60613 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SELENOFO60613 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SELENOFO60613 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SELENOFO60613 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SELENOFO60613 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SELENOFO60613 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SELENOFO60613 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SELENOFO60613 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SELENOFO60613 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SELENOFO60613 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SELENOFO60613 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SELENOFO60613 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SELENOFO60613 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SELENOFO60613 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SELENOFO60613 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SELENOFO60613 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SELENOFO60613 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SELENOFO60613 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SELENOFO60613 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SELENOFO60613 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SELENOFO60613 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SELENOFO60613 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SELENOFO60613 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SELENOFO60613 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SELENOFO60613 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SELENOFO60613 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SELENOFO60613 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SELENOFO60613 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SELENOFO60613 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SELENOFO60613 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SELENOFO60613 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SELENOFO60613 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SELENOFO60613 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SELENOFO60613 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SELENOFO60613 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SELENOFO60613 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SELENOFO60613 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SELENOFO60613 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SELENOFO60613 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SELENOFO60613 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SELENOFO60613 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SELENOFO60613 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SELENOFO60613 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SELENOFO60613 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SELENOFO60613 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SELENOFO60613 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SELENOFO60613 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SELENOFO60613 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SELENOFO60613 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SELENOFO60613 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SELENOFO60613 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SELENOFO60613 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SELENOFO60613 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms