Protein–RNA interactions for Protein: O60563

CCNT1, Cyclin-T1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNT1O60563 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNT1O60563 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNT1O60563 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNT1O60563 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNT1O60563 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNT1O60563 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNT1O60563 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNT1O60563 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCNT1O60563 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCNT1O60563 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCNT1O60563 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCNT1O60563 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCNT1O60563 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCNT1O60563 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCNT1O60563 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCNT1O60563 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCNT1O60563 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCNT1O60563 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCNT1O60563 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CCNT1O60563 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCNT1O60563 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCNT1O60563 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCNT1O60563 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCNT1O60563 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CCNT1O60563 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CCNT1O60563 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCNT1O60563 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCNT1O60563 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCNT1O60563 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCNT1O60563 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCNT1O60563 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCNT1O60563 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCNT1O60563 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCNT1O60563 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCNT1O60563 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCNT1O60563 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCNT1O60563 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCNT1O60563 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCNT1O60563 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCNT1O60563 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CCNT1O60563 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCNT1O60563 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCNT1O60563 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCNT1O60563 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCNT1O60563 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCNT1O60563 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCNT1O60563 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCNT1O60563 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCNT1O60563 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCNT1O60563 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CCNT1O60563 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CCNT1O60563 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCNT1O60563 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCNT1O60563 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCNT1O60563 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCNT1O60563 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCNT1O60563 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCNT1O60563 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCNT1O60563 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCNT1O60563 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCNT1O60563 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCNT1O60563 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCNT1O60563 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCNT1O60563 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCNT1O60563 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCNT1O60563 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCNT1O60563 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCNT1O60563 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCNT1O60563 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCNT1O60563 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCNT1O60563 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCNT1O60563 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCNT1O60563 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCNT1O60563 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCNT1O60563 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CCNT1O60563 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCNT1O60563 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CCNT1O60563 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCNT1O60563 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCNT1O60563 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCNT1O60563 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCNT1O60563 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCNT1O60563 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCNT1O60563 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCNT1O60563 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCNT1O60563 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCNT1O60563 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCNT1O60563 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCNT1O60563 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCNT1O60563 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCNT1O60563 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCNT1O60563 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCNT1O60563 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCNT1O60563 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCNT1O60563 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCNT1O60563 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCNT1O60563 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCNT1O60563 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCNT1O60563 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCNT1O60563 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms