Protein–RNA interactions for Protein: O60522

TDRD6, Tudor domain-containing protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD6O60522 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TDRD6O60522 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TDRD6O60522 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TDRD6O60522 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TDRD6O60522 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TDRD6O60522 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TDRD6O60522 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TDRD6O60522 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TDRD6O60522 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TDRD6O60522 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TDRD6O60522 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TDRD6O60522 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TDRD6O60522 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TDRD6O60522 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TDRD6O60522 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TDRD6O60522 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TDRD6O60522 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TDRD6O60522 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TDRD6O60522 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TDRD6O60522 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TDRD6O60522 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TDRD6O60522 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TDRD6O60522 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TDRD6O60522 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TDRD6O60522 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TDRD6O60522 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TDRD6O60522 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TDRD6O60522 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDRD6O60522 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDRD6O60522 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TDRD6O60522 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDRD6O60522 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDRD6O60522 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDRD6O60522 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDRD6O60522 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDRD6O60522 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDRD6O60522 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDRD6O60522 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDRD6O60522 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TDRD6O60522 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDRD6O60522 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TDRD6O60522 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TDRD6O60522 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TDRD6O60522 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TDRD6O60522 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TDRD6O60522 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TDRD6O60522 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
TDRD6O60522 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TDRD6O60522 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TDRD6O60522 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TDRD6O60522 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TDRD6O60522 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TDRD6O60522 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TDRD6O60522 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TDRD6O60522 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TDRD6O60522 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TDRD6O60522 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TDRD6O60522 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TDRD6O60522 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TDRD6O60522 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TDRD6O60522 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TDRD6O60522 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TDRD6O60522 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TDRD6O60522 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TDRD6O60522 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TDRD6O60522 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TDRD6O60522 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TDRD6O60522 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TDRD6O60522 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TDRD6O60522 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TDRD6O60522 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TDRD6O60522 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TDRD6O60522 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TDRD6O60522 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TDRD6O60522 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TDRD6O60522 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TDRD6O60522 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TDRD6O60522 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TDRD6O60522 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TDRD6O60522 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TDRD6O60522 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TDRD6O60522 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TDRD6O60522 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TDRD6O60522 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TDRD6O60522 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TDRD6O60522 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TDRD6O60522 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TDRD6O60522 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TDRD6O60522 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TDRD6O60522 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TDRD6O60522 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TDRD6O60522 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TDRD6O60522 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TDRD6O60522 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TDRD6O60522 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TDRD6O60522 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TDRD6O60522 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TDRD6O60522 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TDRD6O60522 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDRD6O60522 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms