Protein–RNA interactions for Protein: O60481

ZIC3, Zinc finger protein ZIC 3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC3O60481 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZIC3O60481 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZIC3O60481 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZIC3O60481 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZIC3O60481 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZIC3O60481 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZIC3O60481 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZIC3O60481 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZIC3O60481 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZIC3O60481 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZIC3O60481 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ZIC3O60481 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZIC3O60481 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZIC3O60481 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZIC3O60481 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZIC3O60481 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZIC3O60481 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZIC3O60481 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZIC3O60481 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZIC3O60481 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZIC3O60481 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZIC3O60481 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZIC3O60481 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZIC3O60481 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZIC3O60481 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ZIC3O60481 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZIC3O60481 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZIC3O60481 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZIC3O60481 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZIC3O60481 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZIC3O60481 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZIC3O60481 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ZIC3O60481 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZIC3O60481 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZIC3O60481 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZIC3O60481 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZIC3O60481 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZIC3O60481 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZIC3O60481 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZIC3O60481 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZIC3O60481 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZIC3O60481 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZIC3O60481 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIC3O60481 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIC3O60481 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIC3O60481 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIC3O60481 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIC3O60481 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIC3O60481 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIC3O60481 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZIC3O60481 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZIC3O60481 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZIC3O60481 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZIC3O60481 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIC3O60481 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIC3O60481 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIC3O60481 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIC3O60481 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIC3O60481 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZIC3O60481 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZIC3O60481 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZIC3O60481 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZIC3O60481 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ZIC3O60481 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZIC3O60481 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZIC3O60481 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZIC3O60481 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZIC3O60481 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZIC3O60481 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZIC3O60481 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZIC3O60481 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZIC3O60481 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZIC3O60481 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZIC3O60481 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZIC3O60481 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZIC3O60481 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZIC3O60481 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZIC3O60481 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZIC3O60481 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZIC3O60481 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ZIC3O60481 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZIC3O60481 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZIC3O60481 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZIC3O60481 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZIC3O60481 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZIC3O60481 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZIC3O60481 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZIC3O60481 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZIC3O60481 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ZIC3O60481 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZIC3O60481 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZIC3O60481 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ZIC3O60481 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZIC3O60481 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZIC3O60481 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZIC3O60481 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZIC3O60481 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZIC3O60481 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZIC3O60481 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZIC3O60481 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms