Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GRIN3BO60391 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GRIN3BO60391 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
GRIN3BO60391 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GRIN3BO60391 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GRIN3BO60391 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GRIN3BO60391 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GRIN3BO60391 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GRIN3BO60391 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GRIN3BO60391 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GRIN3BO60391 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GRIN3BO60391 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GRIN3BO60391 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GRIN3BO60391 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GRIN3BO60391 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GRIN3BO60391 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GRIN3BO60391 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GRIN3BO60391 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GRIN3BO60391 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GRIN3BO60391 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GRIN3BO60391 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GRIN3BO60391 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GRIN3BO60391 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GRIN3BO60391 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GRIN3BO60391 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GRIN3BO60391 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
GRIN3BO60391 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GRIN3BO60391 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GRIN3BO60391 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GRIN3BO60391 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GRIN3BO60391 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GRIN3BO60391 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
GRIN3BO60391 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GRIN3BO60391 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GRIN3BO60391 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GRIN3BO60391 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GRIN3BO60391 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GRIN3BO60391 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GRIN3BO60391 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GRIN3BO60391 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
GRIN3BO60391 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GRIN3BO60391 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GRIN3BO60391 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GRIN3BO60391 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GRIN3BO60391 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GRIN3BO60391 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GRIN3BO60391 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GRIN3BO60391 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GRIN3BO60391 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GRIN3BO60391 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GRIN3BO60391 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GRIN3BO60391 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GRIN3BO60391 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GRIN3BO60391 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GRIN3BO60391 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GRIN3BO60391 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GRIN3BO60391 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GRIN3BO60391 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GRIN3BO60391 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
GRIN3BO60391 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
GRIN3BO60391 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GRIN3BO60391 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GRIN3BO60391 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GRIN3BO60391 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
GRIN3BO60391 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GRIN3BO60391 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GRIN3BO60391 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GRIN3BO60391 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
GRIN3BO60391 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GRIN3BO60391 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GRIN3BO60391 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GRIN3BO60391 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GRIN3BO60391 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GRIN3BO60391 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GRIN3BO60391 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GRIN3BO60391 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GRIN3BO60391 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GRIN3BO60391 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GRIN3BO60391 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GRIN3BO60391 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GRIN3BO60391 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
GRIN3BO60391 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
GRIN3BO60391 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GRIN3BO60391 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GRIN3BO60391 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GRIN3BO60391 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GRIN3BO60391 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GRIN3BO60391 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GRIN3BO60391 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GRIN3BO60391 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GRIN3BO60391 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GRIN3BO60391 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GRIN3BO60391 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GRIN3BO60391 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GRIN3BO60391 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GRIN3BO60391 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GRIN3BO60391 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GRIN3BO60391 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GRIN3BO60391 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GRIN3BO60391 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 202.8 ms