Protein–RNA interactions for Protein: O55236

Rngtt, mRNA-capping enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RngttO55236 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RngttO55236 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RngttO55236 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RngttO55236 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RngttO55236 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RngttO55236 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RngttO55236 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RngttO55236 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RngttO55236 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RngttO55236 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RngttO55236 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RngttO55236 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RngttO55236 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RngttO55236 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RngttO55236 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RngttO55236 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RngttO55236 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RngttO55236 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RngttO55236 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RngttO55236 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RngttO55236 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RngttO55236 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RngttO55236 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RngttO55236 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RngttO55236 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RngttO55236 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RngttO55236 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RngttO55236 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RngttO55236 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RngttO55236 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RngttO55236 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RngttO55236 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RngttO55236 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RngttO55236 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RngttO55236 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RngttO55236 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RngttO55236 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RngttO55236 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RngttO55236 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RngttO55236 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RngttO55236 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RngttO55236 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RngttO55236 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RngttO55236 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RngttO55236 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RngttO55236 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RngttO55236 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RngttO55236 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RngttO55236 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RngttO55236 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RngttO55236 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RngttO55236 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RngttO55236 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RngttO55236 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RngttO55236 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RngttO55236 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RngttO55236 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RngttO55236 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RngttO55236 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RngttO55236 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RngttO55236 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RngttO55236 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RngttO55236 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RngttO55236 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RngttO55236 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RngttO55236 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RngttO55236 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RngttO55236 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RngttO55236 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RngttO55236 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RngttO55236 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RngttO55236 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RngttO55236 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RngttO55236 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RngttO55236 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RngttO55236 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RngttO55236 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RngttO55236 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RngttO55236 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RngttO55236 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RngttO55236 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RngttO55236 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RngttO55236 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RngttO55236 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RngttO55236 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RngttO55236 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RngttO55236 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RngttO55236 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RngttO55236 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RngttO55236 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
RngttO55236 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RngttO55236 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RngttO55236 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
RngttO55236 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RngttO55236 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RngttO55236 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RngttO55236 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RngttO55236 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RngttO55236 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RngttO55236 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms