Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dsg2O55111 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dsg2O55111 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dsg2O55111 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dsg2O55111 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dsg2O55111 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Dsg2O55111 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dsg2O55111 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Dsg2O55111 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Dsg2O55111 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dsg2O55111 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dsg2O55111 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dsg2O55111 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dsg2O55111 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dsg2O55111 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dsg2O55111 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dsg2O55111 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dsg2O55111 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dsg2O55111 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dsg2O55111 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dsg2O55111 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dsg2O55111 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dsg2O55111 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dsg2O55111 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dsg2O55111 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dsg2O55111 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dsg2O55111 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dsg2O55111 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dsg2O55111 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dsg2O55111 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dsg2O55111 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dsg2O55111 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dsg2O55111 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dsg2O55111 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Dsg2O55111 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dsg2O55111 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dsg2O55111 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dsg2O55111 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dsg2O55111 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dsg2O55111 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dsg2O55111 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dsg2O55111 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dsg2O55111 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dsg2O55111 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dsg2O55111 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dsg2O55111 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dsg2O55111 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dsg2O55111 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dsg2O55111 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dsg2O55111 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dsg2O55111 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dsg2O55111 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dsg2O55111 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dsg2O55111 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dsg2O55111 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dsg2O55111 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dsg2O55111 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dsg2O55111 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dsg2O55111 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dsg2O55111 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dsg2O55111 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dsg2O55111 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dsg2O55111 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dsg2O55111 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dsg2O55111 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Dsg2O55111 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dsg2O55111 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dsg2O55111 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dsg2O55111 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dsg2O55111 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dsg2O55111 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dsg2O55111 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dsg2O55111 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dsg2O55111 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dsg2O55111 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dsg2O55111 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dsg2O55111 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Dsg2O55111 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dsg2O55111 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dsg2O55111 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dsg2O55111 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dsg2O55111 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dsg2O55111 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Dsg2O55111 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Dsg2O55111 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Dsg2O55111 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dsg2O55111 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dsg2O55111 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dsg2O55111 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Dsg2O55111 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Dsg2O55111 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dsg2O55111 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dsg2O55111 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Dsg2O55111 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Dsg2O55111 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dsg2O55111 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dsg2O55111 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dsg2O55111 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dsg2O55111 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dsg2O55111 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms