Protein–RNA interactions for Protein: O55003

Bnip3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip3O55003 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Bnip3O55003 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Bnip3O55003 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Bnip3O55003 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Bnip3O55003 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Bnip3O55003 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Bnip3O55003 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Bnip3O55003 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Bnip3O55003 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Bnip3O55003 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Bnip3O55003 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Bnip3O55003 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Bnip3O55003 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Bnip3O55003 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Bnip3O55003 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Bnip3O55003 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Bnip3O55003 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Bnip3O55003 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Bnip3O55003 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Bnip3O55003 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Bnip3O55003 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Bnip3O55003 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Bnip3O55003 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Bnip3O55003 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Bnip3O55003 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Bnip3O55003 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Bnip3O55003 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Bnip3O55003 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Bnip3O55003 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Bnip3O55003 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Bnip3O55003 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Bnip3O55003 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Bnip3O55003 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Bnip3O55003 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Bnip3O55003 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Bnip3O55003 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Bnip3O55003 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Bnip3O55003 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Bnip3O55003 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Bnip3O55003 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Bnip3O55003 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Bnip3O55003 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Bnip3O55003 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Bnip3O55003 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Bnip3O55003 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Bnip3O55003 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Bnip3O55003 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Bnip3O55003 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Bnip3O55003 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Bnip3O55003 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Bnip3O55003 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Bnip3O55003 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Bnip3O55003 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Bnip3O55003 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Bnip3O55003 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Bnip3O55003 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Bnip3O55003 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Bnip3O55003 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Bnip3O55003 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Bnip3O55003 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Bnip3O55003 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Bnip3O55003 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Bnip3O55003 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Bnip3O55003 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Bnip3O55003 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Bnip3O55003 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Bnip3O55003 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Bnip3O55003 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Bnip3O55003 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Bnip3O55003 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Bnip3O55003 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Bnip3O55003 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Bnip3O55003 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Bnip3O55003 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Bnip3O55003 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Bnip3O55003 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Bnip3O55003 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Bnip3O55003 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Bnip3O55003 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Bnip3O55003 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Bnip3O55003 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Bnip3O55003 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Bnip3O55003 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Bnip3O55003 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Bnip3O55003 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Bnip3O55003 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Bnip3O55003 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Bnip3O55003 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Bnip3O55003 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Bnip3O55003 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Bnip3O55003 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Bnip3O55003 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Bnip3O55003 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Bnip3O55003 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Bnip3O55003 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Bnip3O55003 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Bnip3O55003 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Bnip3O55003 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Bnip3O55003 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Bnip3O55003 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms