Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TsksO54887 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TsksO54887 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TsksO54887 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TsksO54887 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TsksO54887 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TsksO54887 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TsksO54887 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TsksO54887 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TsksO54887 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TsksO54887 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TsksO54887 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TsksO54887 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TsksO54887 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TsksO54887 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TsksO54887 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TsksO54887 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TsksO54887 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TsksO54887 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TsksO54887 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TsksO54887 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TsksO54887 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TsksO54887 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TsksO54887 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TsksO54887 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
TsksO54887 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TsksO54887 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TsksO54887 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TsksO54887 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TsksO54887 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TsksO54887 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TsksO54887 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TsksO54887 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TsksO54887 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TsksO54887 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TsksO54887 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TsksO54887 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TsksO54887 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TsksO54887 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TsksO54887 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TsksO54887 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TsksO54887 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TsksO54887 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TsksO54887 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TsksO54887 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TsksO54887 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TsksO54887 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TsksO54887 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TsksO54887 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TsksO54887 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TsksO54887 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TsksO54887 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TsksO54887 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TsksO54887 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TsksO54887 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TsksO54887 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TsksO54887 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TsksO54887 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TsksO54887 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TsksO54887 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TsksO54887 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TsksO54887 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TsksO54887 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TsksO54887 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TsksO54887 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TsksO54887 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TsksO54887 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TsksO54887 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TsksO54887 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TsksO54887 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TsksO54887 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TsksO54887 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TsksO54887 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TsksO54887 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TsksO54887 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TsksO54887 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TsksO54887 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TsksO54887 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TsksO54887 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TsksO54887 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TsksO54887 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TsksO54887 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TsksO54887 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TsksO54887 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TsksO54887 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TsksO54887 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TsksO54887 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TsksO54887 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TsksO54887 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TsksO54887 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TsksO54887 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TsksO54887 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TsksO54887 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TsksO54887 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TsksO54887 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TsksO54887 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TsksO54887 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TsksO54887 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TsksO54887 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TsksO54887 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms