Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ChkaO54804 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ChkaO54804 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ChkaO54804 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ChkaO54804 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ChkaO54804 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ChkaO54804 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ChkaO54804 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ChkaO54804 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ChkaO54804 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ChkaO54804 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ChkaO54804 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ChkaO54804 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ChkaO54804 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ChkaO54804 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ChkaO54804 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ChkaO54804 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ChkaO54804 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ChkaO54804 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ChkaO54804 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ChkaO54804 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ChkaO54804 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ChkaO54804 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ChkaO54804 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ChkaO54804 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ChkaO54804 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ChkaO54804 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ChkaO54804 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ChkaO54804 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ChkaO54804 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ChkaO54804 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ChkaO54804 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ChkaO54804 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ChkaO54804 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ChkaO54804 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ChkaO54804 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChkaO54804 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ChkaO54804 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChkaO54804 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChkaO54804 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChkaO54804 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChkaO54804 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ChkaO54804 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ChkaO54804 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ChkaO54804 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ChkaO54804 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ChkaO54804 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ChkaO54804 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ChkaO54804 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ChkaO54804 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ChkaO54804 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ChkaO54804 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ChkaO54804 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ChkaO54804 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ChkaO54804 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ChkaO54804 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ChkaO54804 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ChkaO54804 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ChkaO54804 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ChkaO54804 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ChkaO54804 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ChkaO54804 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ChkaO54804 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ChkaO54804 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ChkaO54804 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ChkaO54804 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ChkaO54804 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ChkaO54804 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ChkaO54804 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ChkaO54804 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ChkaO54804 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ChkaO54804 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ChkaO54804 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ChkaO54804 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ChkaO54804 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ChkaO54804 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ChkaO54804 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ChkaO54804 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ChkaO54804 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ChkaO54804 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ChkaO54804 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ChkaO54804 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ChkaO54804 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ChkaO54804 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ChkaO54804 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ChkaO54804 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ChkaO54804 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ChkaO54804 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ChkaO54804 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ChkaO54804 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ChkaO54804 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ChkaO54804 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ChkaO54804 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ChkaO54804 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ChkaO54804 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ChkaO54804 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ChkaO54804 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ChkaO54804 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ChkaO54804 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ChkaO54804 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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