Protein–RNA interactions for Protein: O54724

Cavin1, Caveolae-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin1O54724 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cavin1O54724 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cavin1O54724 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cavin1O54724 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cavin1O54724 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cavin1O54724 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cavin1O54724 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cavin1O54724 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cavin1O54724 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cavin1O54724 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cavin1O54724 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cavin1O54724 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cavin1O54724 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cavin1O54724 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cavin1O54724 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cavin1O54724 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cavin1O54724 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cavin1O54724 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cavin1O54724 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cavin1O54724 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cavin1O54724 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cavin1O54724 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cavin1O54724 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cavin1O54724 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cavin1O54724 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cavin1O54724 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cavin1O54724 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cavin1O54724 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cavin1O54724 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cavin1O54724 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cavin1O54724 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cavin1O54724 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cavin1O54724 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cavin1O54724 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cavin1O54724 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cavin1O54724 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cavin1O54724 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cavin1O54724 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cavin1O54724 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cavin1O54724 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cavin1O54724 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cavin1O54724 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cavin1O54724 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cavin1O54724 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cavin1O54724 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cavin1O54724 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cavin1O54724 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cavin1O54724 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cavin1O54724 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cavin1O54724 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cavin1O54724 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cavin1O54724 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cavin1O54724 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cavin1O54724 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cavin1O54724 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cavin1O54724 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cavin1O54724 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cavin1O54724 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cavin1O54724 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cavin1O54724 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cavin1O54724 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cavin1O54724 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cavin1O54724 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cavin1O54724 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cavin1O54724 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cavin1O54724 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cavin1O54724 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cavin1O54724 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cavin1O54724 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cavin1O54724 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cavin1O54724 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cavin1O54724 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cavin1O54724 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cavin1O54724 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cavin1O54724 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cavin1O54724 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cavin1O54724 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cavin1O54724 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cavin1O54724 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cavin1O54724 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cavin1O54724 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cavin1O54724 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cavin1O54724 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cavin1O54724 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cavin1O54724 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cavin1O54724 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cavin1O54724 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cavin1O54724 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cavin1O54724 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cavin1O54724 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cavin1O54724 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cavin1O54724 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cavin1O54724 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cavin1O54724 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cavin1O54724 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cavin1O54724 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cavin1O54724 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cavin1O54724 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cavin1O54724 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cavin1O54724 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms