Protein–RNA interactions for Protein: O43731

KDELR3, ER lumen protein-retaining receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3O43731 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDELR3O43731 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDELR3O43731 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KDELR3O43731 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDELR3O43731 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDELR3O43731 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDELR3O43731 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDELR3O43731 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KDELR3O43731 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDELR3O43731 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDELR3O43731 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDELR3O43731 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KDELR3O43731 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDELR3O43731 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDELR3O43731 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDELR3O43731 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDELR3O43731 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDELR3O43731 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDELR3O43731 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDELR3O43731 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KDELR3O43731 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDELR3O43731 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDELR3O43731 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDELR3O43731 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDELR3O43731 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDELR3O43731 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDELR3O43731 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDELR3O43731 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDELR3O43731 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDELR3O43731 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDELR3O43731 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDELR3O43731 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDELR3O43731 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDELR3O43731 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDELR3O43731 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDELR3O43731 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDELR3O43731 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDELR3O43731 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDELR3O43731 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDELR3O43731 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDELR3O43731 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDELR3O43731 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDELR3O43731 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDELR3O43731 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDELR3O43731 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KDELR3O43731 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDELR3O43731 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDELR3O43731 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDELR3O43731 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KDELR3O43731 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDELR3O43731 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDELR3O43731 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDELR3O43731 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDELR3O43731 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDELR3O43731 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDELR3O43731 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDELR3O43731 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDELR3O43731 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDELR3O43731 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KDELR3O43731 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDELR3O43731 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDELR3O43731 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDELR3O43731 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDELR3O43731 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDELR3O43731 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KDELR3O43731 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDELR3O43731 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDELR3O43731 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDELR3O43731 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDELR3O43731 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDELR3O43731 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KDELR3O43731 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDELR3O43731 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDELR3O43731 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDELR3O43731 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDELR3O43731 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDELR3O43731 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDELR3O43731 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDELR3O43731 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDELR3O43731 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDELR3O43731 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDELR3O43731 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDELR3O43731 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDELR3O43731 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDELR3O43731 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDELR3O43731 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDELR3O43731 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDELR3O43731 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDELR3O43731 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDELR3O43731 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDELR3O43731 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDELR3O43731 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDELR3O43731 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDELR3O43731 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDELR3O43731 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDELR3O43731 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDELR3O43731 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDELR3O43731 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDELR3O43731 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDELR3O43731 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139 ms