Protein–RNA interactions for Protein: O43303

CCP110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCP110O43303 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCP110O43303 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCP110O43303 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCP110O43303 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCP110O43303 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCP110O43303 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCP110O43303 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCP110O43303 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCP110O43303 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCP110O43303 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCP110O43303 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCP110O43303 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCP110O43303 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCP110O43303 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
CCP110O43303 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCP110O43303 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCP110O43303 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCP110O43303 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCP110O43303 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCP110O43303 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCP110O43303 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCP110O43303 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCP110O43303 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCP110O43303 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCP110O43303 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCP110O43303 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCP110O43303 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CCP110O43303 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCP110O43303 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCP110O43303 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCP110O43303 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCP110O43303 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCP110O43303 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCP110O43303 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCP110O43303 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCP110O43303 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCP110O43303 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCP110O43303 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCP110O43303 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCP110O43303 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCP110O43303 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCP110O43303 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCP110O43303 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCP110O43303 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCP110O43303 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCP110O43303 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCP110O43303 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCP110O43303 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCP110O43303 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCP110O43303 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCP110O43303 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCP110O43303 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCP110O43303 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCP110O43303 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCP110O43303 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCP110O43303 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCP110O43303 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCP110O43303 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCP110O43303 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCP110O43303 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCP110O43303 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCP110O43303 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCP110O43303 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCP110O43303 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCP110O43303 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCP110O43303 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCP110O43303 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCP110O43303 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCP110O43303 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCP110O43303 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CCP110O43303 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCP110O43303 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCP110O43303 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCP110O43303 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCP110O43303 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCP110O43303 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCP110O43303 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCP110O43303 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCP110O43303 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCP110O43303 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCP110O43303 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCP110O43303 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCP110O43303 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCP110O43303 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCP110O43303 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCP110O43303 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCP110O43303 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCP110O43303 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCP110O43303 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCP110O43303 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCP110O43303 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCP110O43303 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCP110O43303 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCP110O43303 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCP110O43303 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCP110O43303 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCP110O43303 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCP110O43303 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCP110O43303 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCP110O43303 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 747.1 ms