Protein–RNA interactions for Protein: O35980

Nthl1, Endonuclease III-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nthl1O35980 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nthl1O35980 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nthl1O35980 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nthl1O35980 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nthl1O35980 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nthl1O35980 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nthl1O35980 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nthl1O35980 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nthl1O35980 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nthl1O35980 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nthl1O35980 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nthl1O35980 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nthl1O35980 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nthl1O35980 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nthl1O35980 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nthl1O35980 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nthl1O35980 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Nthl1O35980 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nthl1O35980 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nthl1O35980 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nthl1O35980 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nthl1O35980 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nthl1O35980 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nthl1O35980 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nthl1O35980 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nthl1O35980 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nthl1O35980 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nthl1O35980 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nthl1O35980 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nthl1O35980 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Nthl1O35980 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nthl1O35980 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nthl1O35980 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nthl1O35980 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nthl1O35980 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nthl1O35980 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nthl1O35980 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nthl1O35980 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nthl1O35980 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nthl1O35980 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nthl1O35980 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nthl1O35980 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nthl1O35980 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nthl1O35980 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nthl1O35980 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nthl1O35980 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nthl1O35980 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nthl1O35980 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nthl1O35980 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nthl1O35980 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nthl1O35980 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nthl1O35980 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nthl1O35980 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nthl1O35980 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nthl1O35980 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nthl1O35980 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nthl1O35980 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nthl1O35980 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Nthl1O35980 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nthl1O35980 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nthl1O35980 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nthl1O35980 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Nthl1O35980 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nthl1O35980 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nthl1O35980 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nthl1O35980 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nthl1O35980 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nthl1O35980 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nthl1O35980 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nthl1O35980 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nthl1O35980 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nthl1O35980 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nthl1O35980 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nthl1O35980 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Nthl1O35980 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nthl1O35980 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nthl1O35980 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nthl1O35980 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nthl1O35980 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nthl1O35980 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nthl1O35980 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nthl1O35980 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nthl1O35980 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nthl1O35980 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nthl1O35980 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nthl1O35980 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nthl1O35980 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nthl1O35980 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nthl1O35980 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nthl1O35980 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nthl1O35980 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nthl1O35980 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nthl1O35980 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nthl1O35980 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nthl1O35980 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nthl1O35980 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nthl1O35980 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nthl1O35980 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nthl1O35980 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nthl1O35980 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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