Protein–RNA interactions for Protein: O35744

Chil3, Chitinase-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chil3O35744 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chil3O35744 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chil3O35744 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chil3O35744 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chil3O35744 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chil3O35744 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chil3O35744 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chil3O35744 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chil3O35744 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chil3O35744 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chil3O35744 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chil3O35744 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chil3O35744 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chil3O35744 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chil3O35744 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chil3O35744 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chil3O35744 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chil3O35744 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chil3O35744 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chil3O35744 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chil3O35744 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chil3O35744 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chil3O35744 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chil3O35744 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chil3O35744 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chil3O35744 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chil3O35744 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chil3O35744 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chil3O35744 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chil3O35744 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chil3O35744 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chil3O35744 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chil3O35744 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chil3O35744 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chil3O35744 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chil3O35744 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chil3O35744 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chil3O35744 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chil3O35744 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Chil3O35744 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Chil3O35744 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Chil3O35744 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Chil3O35744 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Chil3O35744 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chil3O35744 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chil3O35744 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chil3O35744 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chil3O35744 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chil3O35744 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chil3O35744 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chil3O35744 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chil3O35744 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chil3O35744 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chil3O35744 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chil3O35744 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chil3O35744 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Chil3O35744 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chil3O35744 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chil3O35744 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chil3O35744 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chil3O35744 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chil3O35744 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chil3O35744 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chil3O35744 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chil3O35744 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chil3O35744 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chil3O35744 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chil3O35744 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chil3O35744 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chil3O35744 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chil3O35744 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chil3O35744 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Chil3O35744 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chil3O35744 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chil3O35744 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chil3O35744 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chil3O35744 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chil3O35744 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chil3O35744 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chil3O35744 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chil3O35744 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chil3O35744 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chil3O35744 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Chil3O35744 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Chil3O35744 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Chil3O35744 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chil3O35744 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chil3O35744 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chil3O35744 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Chil3O35744 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chil3O35744 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chil3O35744 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chil3O35744 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chil3O35744 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chil3O35744 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chil3O35744 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chil3O35744 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chil3O35744 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chil3O35744 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chil3O35744 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms