Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TnxbO35452 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TnxbO35452 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TnxbO35452 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TnxbO35452 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TnxbO35452 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TnxbO35452 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TnxbO35452 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TnxbO35452 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TnxbO35452 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TnxbO35452 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TnxbO35452 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TnxbO35452 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TnxbO35452 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TnxbO35452 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TnxbO35452 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TnxbO35452 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TnxbO35452 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TnxbO35452 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TnxbO35452 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TnxbO35452 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TnxbO35452 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TnxbO35452 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TnxbO35452 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TnxbO35452 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TnxbO35452 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TnxbO35452 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TnxbO35452 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TnxbO35452 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TnxbO35452 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TnxbO35452 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TnxbO35452 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TnxbO35452 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TnxbO35452 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TnxbO35452 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TnxbO35452 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TnxbO35452 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TnxbO35452 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TnxbO35452 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TnxbO35452 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TnxbO35452 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TnxbO35452 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TnxbO35452 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TnxbO35452 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TnxbO35452 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TnxbO35452 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TnxbO35452 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TnxbO35452 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TnxbO35452 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TnxbO35452 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TnxbO35452 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TnxbO35452 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TnxbO35452 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TnxbO35452 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TnxbO35452 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TnxbO35452 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TnxbO35452 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TnxbO35452 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TnxbO35452 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TnxbO35452 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TnxbO35452 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TnxbO35452 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TnxbO35452 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TnxbO35452 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TnxbO35452 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TnxbO35452 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TnxbO35452 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TnxbO35452 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TnxbO35452 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TnxbO35452 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TnxbO35452 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TnxbO35452 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TnxbO35452 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TnxbO35452 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TnxbO35452 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TnxbO35452 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TnxbO35452 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TnxbO35452 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TnxbO35452 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TnxbO35452 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TnxbO35452 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TnxbO35452 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TnxbO35452 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TnxbO35452 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TnxbO35452 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TnxbO35452 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TnxbO35452 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TnxbO35452 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TnxbO35452 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TnxbO35452 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TnxbO35452 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TnxbO35452 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TnxbO35452 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TnxbO35452 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TnxbO35452 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TnxbO35452 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TnxbO35452 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TnxbO35452 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TnxbO35452 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TnxbO35452 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms