Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Bhlhe40O35185 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bhlhe40O35185 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bhlhe40O35185 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Bhlhe40O35185 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Bhlhe40O35185 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bhlhe40O35185 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bhlhe40O35185 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bhlhe40O35185 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Bhlhe40O35185 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bhlhe40O35185 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bhlhe40O35185 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bhlhe40O35185 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bhlhe40O35185 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Bhlhe40O35185 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Bhlhe40O35185 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bhlhe40O35185 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bhlhe40O35185 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bhlhe40O35185 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Bhlhe40O35185 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bhlhe40O35185 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bhlhe40O35185 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bhlhe40O35185 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bhlhe40O35185 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Bhlhe40O35185 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bhlhe40O35185 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bhlhe40O35185 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Bhlhe40O35185 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bhlhe40O35185 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Bhlhe40O35185 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bhlhe40O35185 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bhlhe40O35185 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Bhlhe40O35185 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Bhlhe40O35185 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bhlhe40O35185 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Bhlhe40O35185 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bhlhe40O35185 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bhlhe40O35185 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Bhlhe40O35185 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bhlhe40O35185 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bhlhe40O35185 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bhlhe40O35185 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bhlhe40O35185 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bhlhe40O35185 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bhlhe40O35185 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bhlhe40O35185 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bhlhe40O35185 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bhlhe40O35185 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bhlhe40O35185 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bhlhe40O35185 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bhlhe40O35185 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bhlhe40O35185 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bhlhe40O35185 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bhlhe40O35185 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bhlhe40O35185 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bhlhe40O35185 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bhlhe40O35185 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bhlhe40O35185 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bhlhe40O35185 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bhlhe40O35185 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bhlhe40O35185 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Bhlhe40O35185 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bhlhe40O35185 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bhlhe40O35185 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bhlhe40O35185 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bhlhe40O35185 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bhlhe40O35185 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bhlhe40O35185 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bhlhe40O35185 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bhlhe40O35185 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Bhlhe40O35185 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bhlhe40O35185 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bhlhe40O35185 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bhlhe40O35185 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bhlhe40O35185 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bhlhe40O35185 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bhlhe40O35185 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bhlhe40O35185 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bhlhe40O35185 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bhlhe40O35185 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Bhlhe40O35185 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bhlhe40O35185 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bhlhe40O35185 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bhlhe40O35185 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bhlhe40O35185 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bhlhe40O35185 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bhlhe40O35185 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bhlhe40O35185 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bhlhe40O35185 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bhlhe40O35185 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bhlhe40O35185 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bhlhe40O35185 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bhlhe40O35185 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bhlhe40O35185 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bhlhe40O35185 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bhlhe40O35185 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bhlhe40O35185 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bhlhe40O35185 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bhlhe40O35185 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bhlhe40O35185 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125 ms