Protein–RNA interactions for Protein: O15335

CHAD, Chondroadherin, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHADO15335 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHADO15335 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHADO15335 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHADO15335 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHADO15335 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHADO15335 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CHADO15335 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CHADO15335 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CHADO15335 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHADO15335 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHADO15335 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHADO15335 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CHADO15335 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHADO15335 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CHADO15335 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHADO15335 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHADO15335 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHADO15335 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHADO15335 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHADO15335 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHADO15335 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHADO15335 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHADO15335 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHADO15335 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHADO15335 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CHADO15335 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHADO15335 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHADO15335 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHADO15335 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHADO15335 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHADO15335 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHADO15335 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHADO15335 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHADO15335 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHADO15335 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHADO15335 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHADO15335 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHADO15335 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHADO15335 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHADO15335 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHADO15335 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHADO15335 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CHADO15335 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHADO15335 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHADO15335 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHADO15335 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHADO15335 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHADO15335 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHADO15335 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHADO15335 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHADO15335 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHADO15335 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHADO15335 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHADO15335 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHADO15335 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHADO15335 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHADO15335 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHADO15335 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHADO15335 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CHADO15335 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHADO15335 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHADO15335 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHADO15335 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHADO15335 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CHADO15335 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHADO15335 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHADO15335 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHADO15335 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHADO15335 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHADO15335 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHADO15335 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHADO15335 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CHADO15335 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHADO15335 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHADO15335 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHADO15335 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHADO15335 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHADO15335 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHADO15335 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHADO15335 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHADO15335 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CHADO15335 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHADO15335 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHADO15335 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHADO15335 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHADO15335 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHADO15335 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHADO15335 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHADO15335 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHADO15335 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHADO15335 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHADO15335 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHADO15335 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHADO15335 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHADO15335 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHADO15335 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHADO15335 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHADO15335 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHADO15335 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHADO15335 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms